Analisis Genomik dan Ekskresi Amonium pada Bakteri Penambat Nitrogen Dyadobacter sp. GMA6
| Main Authors: | SARAH YUMNA AZIZAH, Ir. Jaka Widada, M.Si., Ph.D., Muhammad Saifur Rohman, S.P., M.Si., M. Eng., Ph.D. |
|---|---|
| Format: | Thesis |
| Terbitan: |
S1 MIKROBIOLOGI PERTANIAN Universitas Gadjah Mada
, 2022
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://etd.repository.ugm.ac.id/penelitian/detail/210942 |
Daftar Isi:
- INTISARIANALISIS GENOMIK DAN EKSRESI AMMONIUM PADA BAKTERI PENAMBAT NITROGEN Dyadobacter sp. GMA 6.SARAH YUMNA AZIZAH16/395777/PN/14628Dyadobacter adalah bakteri aerobic dan heterotrofik yang memiliki kemampuan untuk mengikat nitrogen secara non-simbiotik. Bakteri pemfiksasi nitrogen menghasilkan enzim nitrogenase yang dapat mengubah dinitrogen (N2) menjadi amonia (NH3), sehingga amonia dapat dimanfaatkan oleh tanaman. Isolat GMA 6 yang merupakan strain baru Dyadobacter memiliki kemampuan dalam mengekresikan ammonium serta memiliki potensi sebagai Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jumlah eksresi amonium dan analisis genomik pada isolat GMA 6. Uji kemampuan eksresi amonium dilakukan dengan reagent nessler kemudian dilakukan spektofotometer. Identifikasi filogenik dilakukan dengan cara identifikasi molekuler terhadap 23S rRNA untuk menunjukkan hubungan kekerabatan isolat GMA6 dengan spesies Dyadobacter lainnya, dan analisis sekuens genom utuh untuk mengetahui gen yang diduga berhubungan dengan eksresi amonium. Hasil uji eksresi amonium menunjukkan isolat GMA6 mampu mengeksresi amonium sebesar 1,28mM pada jam ke-96 dalam medium bebas N. Hal ini menunjukkan bahwa isolat GMA 6 memiliki kemampuan ekskresi nitrogen 6 kali lebih tinggi dibandingkan dengan Azotobacter sp. dan 2 kali dari GMA 9 sebagai pembanding. Hasil Blast menunjukkan kemiripan gen 23s rRNA dari isolat GMA 6 memiliki kekerabatan 98,33% dengan Dyadobacter fermentans. Berdasarkan analisis genomik, diketahui isolat GMA 6 merupakan spesies baru dari Dyadobacter sp. dan memiliki gen yang diduga berhubungan dengan eksresi amonium.