تقييم التغايرات المظهرية والوراثية للعزلات السريرية لمعقد الفطر
| Main Author: | Ali Hasan, Kawther Mohammed |
|---|---|
| Format: | Article info application/pdf Journal |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
University of Babylon
, 2018
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
https://www.journalofbabylon.com/index.php/JUBPAS/article/view/854 https://www.journalofbabylon.com/index.php/JUBPAS/article/view/854/643 |
Daftar Isi:
- الفطريات M. canis و M. audouiniiو M. ferrugineumثلاثة انواع فطرية تعود لمعقد النوع Arthroderma otae وتكون متقاربة جدا مظهريا ووراثيا. التشخيص التقليدي والذي يتضمن كل من الصفات المظهرية والكيميائية الحياتية عادة ما تنتج نتائج غير واضحة مقارنة مع التشخيص الوراثي بواسطة استخدام تقنيات جزيئية حديثة تعطي نتائج اكثر وضوحا. تضمنت الدراسة الحالية اجراء تتابع للقواعد الناتروجينية لمنطقة ITS region في الدنا الرايبوسومي (rDNA) لعدد من عزلات الفطر Microsporum spp وتحليل الشجرة التطورية لهذه المنطقة وقد اظهرت النتائج ثلاث مجاميع عنقودية لعزلات الفطر A. otae وهو الطور الجنسي للفطر Microsporum spp. تمت مطابقة تتابع العزلات قيد الدراسة مع تتابع العينات المرجعية لقاعدة البيانات في البنك الجيني (GenBank Database) وقد اظهرت النتائج عدد من مناطق التطفير متمثلة اما بفقدان التواصل (Miss matching) او الفجوات الوراثية (Genetic gaps). وبواسطة استخدام برنامج Mega 6 software وعرض المناطق المحافظة بالوان مختلفة لكل قاعدة نايترجينية تحت مستوى 50% لعزلات الفطر A. otae فقد اظهرت نتائج التطابق في الوان القواعد النايتروجينية ان جميع العزلات تنتمي الى نفس النوع في الطور الجنسي.
- canis , M. audouinii and M. ferrugineum are three species ofArthroderma otae com- plex, which morphologically and genetically closely related. Conventional identification of phenotypic and biochemical characteristics are usually yielding unclear results. Geno- typic identification by using modern technique which is yielding more accurate results. In this study, ITS region of rDNA was sequenced and phylogenetic tree analysis for Mi- crosporum spp. were observed three clusters of A. otae isolates. When sequencing identi- fies with the reference strains sequence of GenBank Database detected several mutations in multiple locus either by miss matching or genetic gaps. By using Mega 6 software and display toggle conserved sites at the 50% level with different colors of A. otae isolates showed identification of the colors in the nitrogenous bases alignment belong to the same species of the telomorph.