Analisis Mutasi pada Kodon 531 Pada Gen Rpob Mycobacterium tuberculosis Penyebab Resistensi Rifampisin
| Main Authors: | Cita, Yatnita Parama, Putri, Dwi Hilda |
|---|---|
| Format: | Article info application/pdf eJournal |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
Fakultas Farmasi Universitas Pancasila
, 2017
|
| Online Access: |
http://jifi.farmasi.univpancasila.ac.id/index.php/jifi/article/view/504 http://jifi.farmasi.univpancasila.ac.id/index.php/jifi/article/view/504/320 |
Daftar Isi:
- Tuberculosis (TB) is a serious disesase in the world. According to the WHO, it is estimated more than 3 million people die every year as a result of this infectious disease. One factor that causes diffi culty handling TB chemoteraphy is not effective against the bacteria Mycobacterium tuberculosis that causes TB . Effectiveness of treatment is often hampered by the emergence of bacterial resistance against M. Tuberculosis chemotherapy agents are given. From some research found that bacterial resistance may occur in more one type of chemotherapy agent also known as multi-drug resistance (MDR). Mycobacterium tuberculosis develop resistance mechanisms that are different from other bacteria in general. In prokaryotes, resistance is generally due to the transfer of genetic, either through plasmids,transposons and other. Reference sequence beta sub unit of RNAP protein M. Tuberculosis with accession number NP_215181.1 and M. tucerculosis rpoB gene with accession number NC_000962.3 used to obtain preliminary information from the data base www.ncbi.nlm.gov and www.uniprot.org . Mutation done according to several studies literature. Analysis of the composition, profi le, location and structure of protein using www.expasy.org, TMHMM and http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred. The primer design is done with Primer Design Program. Based on the analysis of mutation in the beta subunit of RNAP protein M. Tuberculosis, codon 531 (Ser ->Leu), it is known that mutations cause changes in some properties and structure of proteins. Possible changes affecting the nature of bacterial resistance to antibiotics rifampicin. However, further analysis needs to be done with the analysis of the docking technique.
- Tuberkulosis (TB) merupakan salah satu penyakit infeksi yang serius di dunia. Menurut WHO, diperkirakan lebih dari 3 juta orang meninggal setiap tahun akibat penyakit menular ini. Salah satu faktor yang menyebabkan kesulitan penanganan kemoterapi TB ternyata tidak efektif melawan bakteri Mycobacterium tuberculosis yang menyebabkan TB. Efektivitas pengobatan sering terhambat oleh munculnya resistensi bakteri terhadap agen imunoterapi M. tuberculosis. Dari beberapa penelitian ditemukan bahwa resistensi bakteri dapat terjadi pada lebih satu jenis agen kemoterapi yang juga dikenal dengan multi drug resistansi (MDR). Mycobacterium tuberculosis mengembangkan mekanisme resistensi yang berbeda dengan bakteri lain pada umumnya. Dalam prokariota, resistensi pada umumnya disebabkan oleh transfer genetik, baik melalui plasmid, transposon dan lainnya. Rangkaian referensi beta sub unit protein RNAP M. tuberkulosis dengan nomor aksesi NP_215181.1 dan gen M. tucerculosis rpoB dengan nomor aksesi NC_000962.3 digunakan untuk mendapatkan informasi pendahuluan dari data base www.ncbi.nlm.gov dan www.uniprot. org. Mutasi dilakukan menurut beberapa literatur studi. Analisis komposisi, profi l, lokasi dan struktur protein menggunakan www.expasy.org, TMHMM dan http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred. Desain primer dilakukan dengan Program Desain Primer. Berdasarkan analisis mutasi pada subunit beta protein RNAP M. tuberkulosis, kodon 531 (Ser->Leu), diketahui bahwa mutasi menyebabkan perubahan pada beberapa sifat dan struktur protein. Kemungkinan perubahan yang mempengaruhi sifat resistensi bakteri terhadap antibiotik rifampisin. Namun, analisis lebih lanjut perlu dilakukan dengan analisis teknik docking.