PENGKLASTERAN PASIEN KANKER LEUKEMIA BERDASARKAN DATA EKSPRESI GEN DENGAN MENGGUNAKAN DEKOMPOSISI NILAI SINGULAR
| Main Authors: | Noviani, Evi, Putra, Yoga Satria |
|---|---|
| Format: | Article info application/pdf eJournal |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
Institut Teknologi Sepuluh Nopember
, 2010
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://iptek.its.ac.id/index.php/limits/article/view/1434 http://iptek.its.ac.id/index.php/limits/article/view/1434/1201 |
Daftar Isi:
- Informasi yang terkandung di dalam rangkaian molekular Deo-xyribonucleic acid (DNA) makhluk hidup dapat diketahui melaluiteknologi microarray. Data microarray menyajikan data tingkatekspresi gen yang umumnya berukuran besar. Satu sampel pada data microarray bisa memiliki ribuan atau puluhan ribu gen. Pada penelitian ini diolah data pasien kanker darah (leukemia) yang berukuran 500032dengan entri tak negatif. Data microarray pasien leukemia dapat diolah dengan menggunakan Dekomposisi Nilai Singular sedemikian sehingga sampel yang memiliki sifat yang sama dikelompokkan dalam satu kelompok. Dekomposisi Nilai Singular digunakan untuk mengelompokkan data dengan dua macam keragaman (bi-clustering), yaitu menggunakan nilai vektor singular kedua dan ketiga. Dari implementasi pada data, pasien kanker dapatdikelompokkan menjadi penyakit AML, dan ALL beserta sub tipepenyakit ALL, yakni ALL-T dan ALL-B.