Analisis Keragaman Sekuens Potyvirus Sebagai Dasar Untuk Perakitan Tanaman Unggul dan Tahan Terhadap Penyakit Yang Disebabkan Oleh Potyviral Melalui Rekayasa Genetik
| Main Authors: | Danial Rahim, Muhammad, Nasruddin, Andi, Sjahril, Rinaldi |
|---|---|
| Format: | Article |
| Terbitan: |
LP2M UNHAS
, 2014
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.unhas.ac.id/handle/123456789/9748 |
Daftar Isi:
- ?????????Salah satu kendala dalam proses produksi pertanian adalah adanya serangan penyakit tanaman, khususnya patogen virus penyebab penyakit. Potyvirus merupakan kelompok virus yang tergolong sebagai salah satu penyebab penyakit penting dengan kisaran tanaman inang yang sangat luas. Perkembangan bioteknologi berbasis biologi molekuler dapat digunakan untuk membantu dalam pengelolaan penyakit virus melalui pendekatan biologi, ekologi, dan epidemiologi penyakit. Oleh karena dalam penelitian ini memanfaatkan pendekatan biologi molekuler untuk karakterisasi populasi genetik potytirus yang menginfeksi tanaman pada komoditas unggulan dan tanaman lainnya dengan pengembangan teknik diagnosis penyakit, deteksi infeksi virus secara dini, cepat dan akurat untuk perakitan tanaman tahan virus melalui rekayasa genetik. Penelitian tahun pertama ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan beberapa jenis virus dan variabilitas genetik potyvirus yang menginfeksi beberapa komoditas pertanian unggulan di Sulawesi Selatan sebagai informasi penting untuk menciptakan tanaman unggul dan tahan terhadap potyviral sehingga menjadi dasar untuk pengembangan tanaman transgenik skala produksi dan dimanfaatkan dalam penerapan teknologi pengendalian penyakit terpadu untuk peningkatan produktivitas pertanian serta memperkuat ketahanan pangan. Penelitian ini direncanakan berlangsung selama tiga tahun dan pada tahun pertama ini meliputi : 1) koleksi material tanaman terinfeksi potyvirus, dan propagasi isolat-isolat virus dan tanaman terinfeksi virus pada tanaman indikator, 2) pengujian serologi dan deteksi infeksi potyvirus dengan menggunakan metode polymerase chain reaction dan optimasinya, 3), karakteristik penularan virus, 4) isolasi dan purifikasi produk amplifikasi DNA potyvirid, 5) sekuensing dan 6) analisis sekuens, analisis filogenetik, distribusi, dan evolusi potyvirus. ????????? Hasil penelitian tahun pertama ini menunjukkan beberapa jenis virus dalam kelompok potyvirus telah menginfeksi beberapa jenis tanaman di Sulawesi Selatan. Potyvirus terindikasi menginfeksi beberapa tanaman inang alternatif di Sulawesi Selatan, dan virus-virus yang menyerang beberapa jenis tanaman diduga memiliki keragaman genetik berdasarkan diagnosis uji biologi dengan inang alternatif dan hasil uji serologi dan karakter molekuler menggunakan metode RT-PCR. Hasil sekuensing yang sementara dilakukan akan memberikan keakuratan data phylogeny serta framework filogenetik, epedimiologi, dan evolusi dari kelompok potyvirus yang bermanfaat dalam tahapan penelitian tahun kedua.