ANALISIS KERAGAMAN SEKUENS POTYVIRUS SEBAGAI DASAR UNTUK PERAKITAN TANAMAN UNGGUL DAN TAHAN TERHADAP PENYAKIT YANG DISEBABKAN OLEH POTYVIRAL MELALUI REKAYASA GENETIK
| Main Authors: | Danial Rahim, Muhammad, Nasruddin, Andi, Sjahril, Rinaldi |
|---|---|
| Format: | Article |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
LP2M
, 2014
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.unhas.ac.id/handle/123456789/12043 |
Daftar Isi:
- S alah satu kendala dalam proses produksi pertanian adalah adanya serangan penyakit tanaman , khususnya patogen virus penyebab penyakit . Potyvirus merupakan kelompok virus yang tergolong sebagai salah satu penyebab penyakit penting dengan kisaran tanaman inang yang sangat luas . P erkembangan bioteknologi berb asis biologi molekuler dapat digunakan untuk membantu dalam pengelolaan penyakit virus melalui pendekatan biologi, ekologi, dan epidemiologi penyakit . Oleh karena dalam penelitian ini memanfaatkan pendekatan biologi molekuler untuk karakterisasi populasi genetik potytirus yang menginfeksi tanaman pada komoditas unggulan dan tanaman lainnya dengan p en gembangan teknik diagnosis penyakit , deteksi infeksi virus secara dini, cepat dan akurat untuk perakitan tanaman tahan virus melalui rekayasa genetik. Peneliti an tahun pertama ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan beberapa jenis virus dan variabilitas geneti k potyvirus yang menginfeksi beberapa komoditas pertanian unggulan di Sulawesi Selatan sebagai informasi penting untuk menciptakan tanaman unggul dan tah an terhadap potyviral sehingga menjadi dasar untuk pengembangan tanaman transgenik skala produksi dan dimanfaatkan dalam penerapan teknologi pengendalian penyakit terpadu untuk peningkatan produk tivitas pertanian serta memperkuat ketahanan pangan. P eneliti an ini direncanakan berlangsung selama t i ga tahun dan pada tahun pertama ini meliputi : 1) koleksi material tanaman terinfeksi potyvirus , dan propagasi isolat - isolat virus dan tanaman terinfeksi virus pada tanaman indikator , 2) pengujian serologi dan deteksi infeksi potyvirus dengan menggunakan metode polymerase chain reaction dan optimasinya, 3), karakteristik penularan virus, 4) isolasi dan purifikasi produk amplifikasi DNA potyvir id, 5) sekuensing dan 6) analisis sekuens, analisis filog enetik, distribusi , dan evolusi potyvirus . Hasil penelitian tahun pertama ini menunjukkan beberapa jenis virus dalam kelompok potyvirus telah menginfeksi beberapa jenis tanaman di Sulawesi Selatan. Potyvirus terindikasi menginfeksi beberapa tanaman inang alternatif di Sulawesi Selatan, dan virus - virus yang menyerang beberapa jenis tanaman diduga memiliki keragaman genetik berdasarkan diagnosis uji biologi dengan inang alternatif dan hasil uji serologi dan karakter molekuler menggunakan metode RT - PCR. Has il sekuensing yang sementara dilakukan akan memberikan keakuratan data phylogeny serta framework filogenetik, epedimiologi, dan evolusi dari kelompok potyvirus yang bermanfaat dalam tahapan penelitian tahun kedua