Potensi Inhibisi Enzim -Hydroxy-3-Methyl Glutaryl (Hmg)-Coa Reduktase (Hmgr) Oleh Bioaktif Peptida Dari Csn1s2 Susu Kambing Peranakan Ethawah Pada Hiperkolesterolemia Secara In Silico
| Main Author: | Natasia, Shella Clarista |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed |
| Terbitan: |
, 2018
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/8692/ |
Daftar Isi:
- Pengobatan hiperkolesterolemia yang sering digunakan adalah statin yang mampu menurunkan kadar kolesterol melalui inhibisi enzim 3-hydroxy-3-methyl glutaryl (HMG) CoA reduktase (HMGR), namun statin dapat menimbulkan efek samping. Oleh karena itu, harus dicari alternatif pengobatan alami seperti bioaktif peptida dari protein CSN1S2 susu kambing peranakan Ethawah. Penelitian ini dilakukan untuk menganalisis potensi bioaktif peptida protein CSN1S2 sebagai inhibitor HMGR secara in silico. Struktur tiga dimensi HMGR didapatkan dari database PDB ID: 1DQ9 diinteraksikan dengan delapan bioaktif peptida dari protein CSN1S2 susu kambing peranakan Ethawah dengan menggunakan ClusPro. Data hasil docking divisualisasi dan dianalisis dengan menggunakan Discovery Studio, PyMol, LigPlot+. Hasil docking menunjukkan bahwa empat dari delapan peptida caprine CSN1S2 dapat berinteraksi dengan sisi aktif HMGR yaitu fragmen 41-NMAIHPR-47, 87-ITVDDKHYQK-96, 214-TNAIPVYR-221, dan 214-TNAIPYVRL-223. Empat fragmen tersebut memiliki kesamaan lokasi dengan lokasi interaksi antara HMGR dan HMG-CoA kecuali fragmen 87-ITVDDKHYQK-96. Lokasi interaksi tersebut adalah E559, D767, H866, terutama bagian cis-loop yaitu residu HMGR nomor 684 sampai 692. Fragmen 41-NMAIHPR-47 memiliki 17 ikatan hidrogen dengan energi ikatan sebesar -634,8 kJ/mol, fragmen 214-TNAIPVYR-221 memiliki 21 ikatan hidrogen dengan energi ikatan -765 kJ/mol, dan fragmen 214-TNAIPYVRL-223 memiliki 24 ikatan hidrogen dengan energi ikatan -1010,4 kJ/mol. Hasil tersebut menunjukkan bahwa ketiga peptida diatas berpotensi menjadi inhibitor HMGR dengan kebutuhan energi yang rendah.