Isolasi Dan Identifikasi Molekuler Bakteri Endofit Akar Mangrove Sonneratia Alba Penghasil Enzim Gelatinase
Main Author: | Fitriyah, Umaya Rizka |
---|---|
Format: | Thesis NonPeerReviewed |
Terbitan: |
, 2017
|
Subjects: | |
Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/8245/ |
Daftar Isi:
- Enzim gelatinase merupakan enzim yang menghidrolisis gelatin menjadi polipeptida, peptida dan asam amino.Enzim gelatinase merupakan salah satu enzim yang penting karena perannya dalam menghasilkan hidrolisat gelatin.Hidrolisis gelatin secara enzimatis menghasilkan hidrolisat gelatin yang mengandung asam amino glisin, prolin, dan hidroksiprolin yang mempunyai sifat sebagai antioksidan dan antihipertensi.Salah satu sumber enzim gelatinase yaitu bakteri endofit.Bakteri endofit merupakan bakteri yang hidup di dalam jaringan tumbuhan dan mampu untuk membentuk suatu koloni dalam jaringan tumbuhan tanpa memberi efek negatif pada tumbuhan yang ditempatinya sebagai inang.Bakteri endofit yang didapatkan diidentifikasi molekuler gen penyandi 16S rRNA. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendapatkan bakteri endofit akar mangrove Sonneratia albayang mampu menghasilkan enzim gelatinase serta untuk mengetahui homologi atau kemiripan bakteri endofit mangrove Sonneratia alba berdasarkan hasil identifikasi molekuler gen penyandi 16S rRNA. Metode yang digunakan adalah metode deskriptif eksploratifdengan dua tahap penelitian.Tahap pertama dimulai dari pengambilan sampel akar mangrove Sonneratia alba dari Pantai Aeng Sareh, Madura, kemudian isolasi bakteri endofit dari akar mangrove Sonneratia alba, dan skrining gelatinase. Tahap kedua penelitian adalah identifikasi molekuler, dan konfirmasi dengan pewarnaan gram.Berdasarkan isolasi bakteri diperoleh 4 isolat bakteri.Hasil dari skrining aktivitas enzim gelatinase diperoleh 4 isolat bakteri mampu menghasilkan enzim gelatinase.Hasil terbaik terdapat pada isolat bakteri A2, sehingga diidentifikasi untuk mengetahui jenis spesiesnya berdasarkan 16S rRNA.Berdasarkan hasil identifikasi molekuler gen penyandi 16S rRNA isolat bakteri A2 memiliki kemiripan dengan bakteri Lysinibacillus fusiformis dengan nilai similaritas 87% dan diberi nama sebagai Lysinibacillus fusiformis UB-U. Berdasarkan hasil filogenetik, Lysinibacillus fusiformis UB-U memiliki hubungan yang lebih dekat dengan Lysinibacillus boronitolerans strain DNP-20 dengan nilai bootstrap 87%. Lysinibacillus fusiformis UB-U adalah gram negatif dan berbentuk batang (basil).