Analisa Gen Tlr9 Dan Konfirmasi Protein Tlr9 Pada Gajah Sumatera (Elephas maximus sumatranus) Di Taman Safari Indonesia 2 Prigen
Main Author: | Utami, Ristanti Putri |
---|---|
Format: | Thesis NonPeerReviewed |
Terbitan: |
, 2017
|
Subjects: | |
Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/3921/ |
Daftar Isi:
- TLR9 (Toll-like Receptors 9) merupakan salah satu anggota dari kelompok TLRs (Toll-like Receptors) berupa protein yang memiliki fungsi sebagai reseptor suatu patogen pada individu. TLR9 merupakan protein yang dikode oleh gen TLR9, berlokasi dibagian intraseluler tepatnya dalam endosom. Analisa TLR9 sangat penting dilakukan untuk mengetahui apakah suatu individu terinfeksi oleh suatu penyakit. Misalnya pada Gajah Sumatera yang bisa terserang oleh penyakit EEHV (Elephant Endothelial Herpes Virus) merupakan penyakit spesifik yang menginfeksi gajah. Analisa gen TLR9 pernah dilakukan pada Gajah Afrika, sehingga penelitian TLR9 pada Gajah Sumatera perlu dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisa gen TLR9 berdasarkan sekuen gen dan mengkonfirmasi protein TLR9 pada Gajah Sumatera menggunakan sampel darah dari Gajah Sumatera. Analisa gen dilakukan dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan primer forward (TLR9_F) 5’-GAACTA TCCCTGCCACATGA-3’ dan primer reverse (TLR9_R) 5’-CGTGCACGGAT TCTTGTAGT-3’ sedangkan analisa protein dilakukan dengan melihat profil protein menggunakan metode SDS-PAGE selanjutnya dihitung berat molekul dengan menggunakan rumus Retardation factor (Rf) dan kemudian dianalisa secara deskriptif. Hasil penelitian analisa gen TLR9 menunjukkan terdapat perbedaan sekuen DNA antara Gajah Afrika dan Gajah Sumatera pada urutan basa 1.429 dimana sitosin (C) menjadi timin (T). Hasil analisa profil protein menunjukkan adanya pita protein dengan berat molekul sebesar 116,19 kDa yang ditemukan pada protein yang diisolasi dari darah Gajah Sumatera yang diduga merupakan protein dari TLR9.