Analisis Filogenetik Ikan Gabus (Channa striata) Berdasarkan DNA Mitokondria Region Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) pada Daerah Aliran Sungai (DAS) Bengawan Solo, Desa Raci Tengah, Kecamatan Sidayu, Kabupaten Gresik.Wahyu Endra Kusuma, S.Pi, MP, D.Sc.Dan Budianto, S.Pi, MP, M.Sc
| Main Author: | Sufaichusan, Ifa |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
, 2021
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/186664/1/Ifa%20Sufaichusan.pdf http://repository.ub.ac.id/186664/ |
Daftar Isi:
- Sungai Bengawan Solo merupakan sungai terpanjang di Pulau Jawa yang terletak antara 6,48°– 8,07° LS dan 110,26°– 112,41° BT. Salah satu wilayah yang dilewati Sungai Bengawan Solo adalah Desa Raci Tengah, Kecamatan Sidayu, Kabupaten Gresik, Jawa Timur dan salah satu famili yang ditemukan di Sungai Bengawan Solo berasal dari famili Channidae, genus Channa spesies Channa striata (ikan gabus). Ikan gabus di Sungai Bengawan Solo memiliki kemampuan adaptasi terhadap lingkungan yang tidak terlalu tinggi akibat dari pencemaran lingkungan. Tingginya tingkat pencemaran dan banyaknya eksploitasi ikan gabus menyebabkan berkurangnya populasi ikan gabus di alam, sehingga diperlukan suatu upaya konservasi dan domestikasi sebelum dilakukan kegiatan budidaya untuk menjaga populasi ikan gabus dengan cara mengidetifikasi asal usul ikan gabus melalui studi filogenetik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui, menganalisis dan mendeskripsikan hubungan kekerabatan melalui studi filogenetik yang dilakukan pada spesies ikan gabus di Daerah Aliran Sungai (DAS) Bengawan Solo, Kabupaten Gresik, Jawa Timur. Penelitian ini dilaksanakan pada Laboratorium Hidrobiologi Divisi Sumberdaya Perikanan Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan dan Laboratorium Ekologi dan Diversitas Hewan Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Brawijaya, Malang. Penelitian ini menggunakan metode deskriptif dengan menggunakan parameter jarak genetik, takson, clade, bootstrap, similaritas dan hubungan kekerabatan. Hasil analisis diperoleh panjang urutan basa ikan gabus Gresik sebesar ±655 bp dengan hasil BLAST Ikan gabus di daerah Gresik dengan ikan C. striata dari NCBI diperoleh nilai query cover sebesar 99,69%-100%. Analisa jarak genetik ikan C. striata di beberapa wilayah didapatkan jarak genetik terendah pada spesies C.striata yang berasal dari Thailand dengan persentase jarak genetik 0%, sedangkan jarak genetik tertinggi terdapat pada spesies C. marulius dari Myanmar dengan jarak genetik sebesar 9,68%, sedangkan analisa jarak genetik intraspesies didapatkan ikan gabus tertinggi diperoleh dari ikan C. marulius Myanmar dengan hasil 0,18 dan terendah pada ikan C. striata Malaysia dengan hasil 0,01. Analisa filogenetik menunjukkan pohon dengan skala 0,02 atau dapat diartikan terdapat perbedaan genetik sebanyak 2% dan terbagi menjadi 3 kelompok. Hasil analisis menunjukkan ikan gabus gresik memiliki hubungan kekerabatan yang tergolong dekat dengan ikan C. striata dan memiliki hubungan kekerabatan yang jauh dengan ikan C. melasoma dan ikan C. marulius.