Daftar Isi: Klasifikasi Jenis Kanker Berdasarkan Tingkat Ekspresi Gen Pasien Penderita Kanker Menggunakan Metode Vertex Discriminant Analysis

Daftar Isi:

Analisis diskriminan adalah analisis multivariat yang diterapkan untuk memodelkan hubungan antara peubah respon berupa data kualitatif dan peubah prediktor berupa data kuantitatif. Analisis diskriminan dengan jumlah peubah prediktor lebih banyak daripada jumlah amatan dapat ditangani dengan menggunakan metode Vertex Discriminant Analysis (VDA). VDA mengklasifikasikan objek dengan mengembangkan metode analisis diskriminan menggunakan simpul (vertex) dari simpleks pada ruang Euclidean. VDA dapat digunakan untuk menangani kasus data yang tidak memenuhi asumsi matriks varians kovarians yang homogen dan asumsi normal multivariat. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk membentuk fungsi diskriminan untuk mengklasifikasikan pasien ke dalam lima kategori jenis kanker. Data yang digunakan pada penelitian ini berupa gen manusia yang menderita suatu jenis kanker sebanyak 685 dan amatan sebanyak 60 pasien yang diklasifikasikan ke dalam lima jenis kanker. Kelima jenis kanker pada penelitian ini, yaitu BRCA (Breast Invasive Carcinoma), COAD (Colon Adenocarcinoma), KIRC (Kidney Renal Clear Cell Carcinoma), LUAD (Lung Adenocarcinoma) dan PRAD (Prostate Adenocarcinoma). Hasil analisis menunjukkan bahwa metode VDA membentuk empat fungsi diskriminan untuk membedakan lima jenis kanker. VDA mampu mengklasifikasikan dengan tepat 48 dari 48 data training, sedangkan untuk data testing VDA mengklasifikasikan dengan tepat 6 dari 12 data dengan kesalahan klasifikasi (APER) sebesar 50%.