Analisis Keragaman Gen Secreted Phospoprotein 1 (SPP1) terhadap Kualitas Semen Segar Pada Sapi Limousin (Bos Taurus) Jantan dengan Metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymophism
| Main Author: | Setiyoningrum, Astika Dwi Sawitri |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
, 2020
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/181312/1/Astika%20Dwi%20Sawitri%20Setiyoningrum%20%282%29.pdf http://repository.ub.ac.id/181312/ |
Daftar Isi:
- Gen secreted phospoprotein 1 (SPP1) pada sapi terletak pada kromosom 6 yang terdiri atas tujuh exon dan enam intron dengan ukuran sekitar 7.000 basa dari total genom. Fungsi dari protein SPP 1 sebagai salah satu faktor dekapasitasi untuk mencegah aktivasi dini motilitas sperma. Salah satu teknik yang dapat diaplikasikan dalam mendeteksi adanya polimorfisme yaitu Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymophism (PCR-RFLP). Teknik tersebut memerlukan beberapa tahapan, antara lain isolasi DNA, amplifikasi gen SPP1 menggunakan metode PCR dengan primer SPP1 F 5’ - GCAAATCAGAAGTGATAGA - 3’ dan SPP 1 R 5’ - CCAAGCCAAACGTATGAGTT - 3 (290bp), elektroforesis, dan RFLP menggunakan enzim restriksi HindIII. Kemudian data yang didapatkan akan di analisa menggunakan uji Spearman. Hasil korelasi antara jumlah pita RFLP dengan konsentrasi semen menunjukkan korelasi lemah dan searah (r=0,231), sementara korelasi jumlah pita RFLP dengan motilitas semen menunjukkan korelasi sangat lemah dan tidak searah (r=0,072). Berdasarkan hasil tersebut polimorfisme gen SPP1 memiliki pengaruh terhadap kualitas semen segar khususnya pada motilitas dan konsentrasi sperma.