Uji In Silico Ikatan Lysenin Cacing Tanah (Lumbricus rubellus) dengan Vimentin terhadap AKT1 sebagai Agen Kokemoterapi 5-FU pada Kanker Kolorektal
| Main Author: | Fadhilah, Nurul Reza |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
, 2019
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/180142/1/Nurul%20Reza%20Fadhilah.pdf http://repository.ub.ac.id/180142/2/MAJALAH_Nurul%20Reza%20Fadhilah_165070107111045.pdf http://repository.ub.ac.id/180142/ |
Daftar Isi:
- Kanker merupakan kondisi terjadinya pertumbuhan sel yang tidak terkontrol. Kanker kolorektal adalah kanker ketiga yang paling sering didiagnosis dan menduduki peringkat ke-2 sebagai jenis kanker yang sering menyebabkan kematian di dunia tahun 2018. Pada kanker kolorektal terdapat peningkatan vimentin yang berperan dalam apoptosis. AKT1 yang berikatan dengan vimentin menyebabkan fosforilasi vimentin menghasilkan gagal apoptosis. Terhambatnya fosforilasi vimentin mengakibatkan apoptosis melalui caspase. Salah satu terapi yang digunakan adalah kemoterapi yaitu 5-Fluorouracil (5-FU) yang bekerja menghambat enzim thymidyate synthase. Namun, pemberian kemoterapi tunggal menimbulkan berbagai efek samping serta kurang memberikan efek yang adekuat sehingga perlu dikombinasikan dengan agen yang dapat bekerja sinergis sebagai agen kokemoterapi. Lumbricus rubellus memiliki potensi sebagai antikanker melalui kandungan lysenin dan kombinasi cairan coelomic Lumbricus rubellus dengan 5-FU dapat meningkatkan apoptosis sel. Penelitian ini dilakukan untuk memprediksi secara molekuler peran lysenin dalam berikatan dengan vimentin sehingga terjadi apoptosis dan berperan sinergis sebagai kokemoterapi kanker kolorektal. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental in silico melalui metode docking menggunakan sampel dari database pubchem dan Protein Data Bank, yang bertujuan untuk mengetahui daya ikatan lysenin dengan vimentin. Metode molecular docking dalam penelitian ini dilakukan menggunakan software PyRX 0.8, Patchdock, Firedock untuk mengetahui afinitas ikatan, PyMOL 2.0.6 untuk melihat dalam 3 dimensi dan Ligplot untuk melihat ikatan asam amino. Hasilnya docking didapatkan afinitas ikatan lysenin dengan vimentin sebesar -37,69 kkal/mol sementara afinitas ikatan Vimentin dengan AKT1 (kontrol) sebesar -23,04. Lysenin memiliki afinitas ikatan yang lebihi tinggi maka, lysenin berpotensi menghambat fosforilasi vimentin sehingga terjadi apoptosis dan berpotensi sebagai terapi kombinasi untuk kanker kolorektal.