Uji Ikatan Antara Kuersetin dalam Benalu Mangga (Dendrophthoe pentandra) dengan β-tubulin III (TUBB3) Sebagai Agen Kokemoterapi Paclitaxel pada Sel Kanker Payudara Secara In Silico
| Main Author: | Besari, Amalda Widia |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
, 2019
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/179867/1/Amalda%20Widia%20Besari.pdf http://repository.ub.ac.id/179867/2/MAJALAH_Amalda_165070107111034.pdf http://repository.ub.ac.id/179867/ |
Daftar Isi:
- Kanker payudara merupakan keganasan pada jaringan payudara yang bisa berasal dari epitel duktus maupun lobulusnya. Pada kanker payudara terdapat ekspresi β-TUBULIN III (TUBB3) yang merupakan salah satu protein penting yang terkait dengan penyusunan mikrotubulus. Salah satu terapi kanker payudara adalah kemoterapi menggunakan paclitaxel. Paclitaxel bekerja dengan mengikat tubulin yang merupakan komponen protein mikrotubulus, sekaligus mempromosikan penyusunan dan pembongkaran tubulin untuk membentuk mikrotubulus yang stabil dan tidak berfungsi sehingga menyebabkan kematian sel. Namun, pemberian kemoterapi tunggal menimbulkan berbagai efek samping serta kurang memberikan efek yang adekuat sehingga perlu dikombinasikan dengan agen yang dapat bekerja sinergis sebagai agen kokemoterapi. Kuersetin pada benalu mangga memiliki potensi sebagai antikanker dengan cara menghambat proliferasi sel kanker dan menipiskan mikrotubulus seluler. Penelitian ini dilakukan untuk memprediksi secara molekuler peran kuersetin dalam berikatan dengan TUBB3 sehingga terjadi apoptosis dan berperan sinergis sebagai kokemoterapi kanker payudara. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental in silico melalui metode docking menggunakan sampel dari database pubchem dan Protein Data Bank, yang bertujuan untuk mengetahui daya ikatan kuersetin dengan TUBB3. Metode molecular docking dalam penelitian ini dilakukan menggunakan software PyRX 0.8, untuk mengetahui afinitas ikatan, PyMOL 2.0.6 untuk melihat dalam 3 dimensi dan Ligplot untuk melihat ikatan asam amino. Hasilnya docking didapatkan afinitas ikatan kuersetin dengan TUBB3 sebesar -9,4 kkal/mol sementara afinitas ikatan TUBB3 dengan GTP (kontrol) sebesar -8,9. Kuersetin memiliki afinitas ikatan yang lebihi tinggi maka, kuersetin berpotensi menggantikan posisi ligan control dan menimbulkan efek anti kanker nya.