Analisa Perbedaan Gen Warna Rambut Sapi Jaliteng (Jawa Bali Banteng) Jantan Dan Betina Berdasarkan Sekuen Gen Melanocortin-1 Receptor (Mc1r) Dengan Metode Polymerase Chainreaction (Pcr)
Main Author: | Siska, Parasmita Anggrian |
---|---|
Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
Bahasa: | eng |
Terbitan: |
, 2019
|
Subjects: | |
Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/177016/1/PARASMITA%20ANGGRIAN%20SISKA%20%282%29.pdf http://repository.ub.ac.id/177016/ |
Daftar Isi:
- Sapi Jaliteng (SJ/Jawa Bali Banteng) merupakan hasil persilangan antara Sapi Bali dan Banteng jawa.Sapi Jaliteng memiliki keunikan pada warna rambut jaliteng jantan dan betina memiliki warna rambut coklat yang mengalami perubahan jantan dewasa menjadi hitam dan betina dewasa tetap berwarna coklat.Melanocortin-1 Receptor (MC1R) merupakan gen penentu warna rambut dan kulit pada mamalia. Gen MC1R meregulasi melanosit untuk membentuk pigmen melanin yang kemudian pigmen tersebut menghasilkan eumelanin dan feomelanin. Individu yang memiliki eumelanin memiliki rambut berwarna hitam dibandingkan dengan individu yang memiliki feomelanin lebih memiliki rambut oranye hingga kemerahan. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan perbedaan warna rambut Sapi Jaliteng (SJ) Jantan dan Sapi Jaliteng (SJ) Betina. Sampel yang digunakan adalah Sapi Jaliteng (SJ1) , Sapi Bali (SB), Banteng (B) Sapi Jaliteng (SJ2),Sapi Jaliteng (SJ3),Sapi Jaliteng (SJ4),Sapi Jaliteng (SJ5) dan Sapi Jaliteng (SJ6) mengisolasi DNA melalui sampel darah lalu dilakukan uji kuantitas dan kualitas DNA, kemudian diamplifikasi menggunakan metode PCR(Polymerase Chain Reaction) dengan primer Forward MC1R_F‘5ACAATGTCATCGACGTGCTC3’dan primer Reverse MC1R_R’5AGCTATGAAGAGGCCAACGA3’.Analisasekuen SJ dan SBdilakukan dengan metodesekuensing terhadap produk PCR serta analisis dilakukan denganmenggunakan software BioEdit dan NCBI BLAST. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen MC1R dengan sampel SJ3 mengalami mutasi gen dengan terjadi delesi pada sekuen ke-937 (C.937delT) yang menyebabkan delesiphenylalanin (F) yaitu p.179delF pada transmembrane region MC1R. Kesimpulan terdapat perbedaan sekuen nukleutida dan asam amino di gen MC1R antara Sapi Jaliteng (SJ3) yang memiliki eumelanin dominan dari sampel Sapi Jeliteng Betina (SJ2) dan sampel Sapi Bali (SB) berambut terang yang memiliki feomelanin dominan.