Analisa Kekerabatan Common Snapping Turtle (Chelydra Serpentina) Berdasarkan Sekuen Gen Cytochrome-B (Cyt-B) Dengan Metode Polymerase Chain Reaction
| Main Author: | Khairunisa, Yuliastuti |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
, 2019
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/176904/1/Yuliastuti%20Khairunisa%20-%20155130101111032%20%282%29.pdf http://repository.ub.ac.id/176904/ |
Daftar Isi:
- Common Snapping Turtle (Chelydra serpentina) adalah salah satu dari tiga spesies kura-kura famili Chelydridae. Common snapping turtle memiliki status least concern menurut International Union for Conservation of Nature (IUCN) dan special concern menurut Committe on The Status of Endangered Wildlife in Canada (COSEWIC). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tingkat kekerabatan antar individu common snapping turtle dan membandingkan kedekatannya dengan sekuen gen CYT B alligator snapping turtle, central american river turtle, dan arizona mud turtle dari data NCBI. DNA didapatkan dari tiga sampel wholeblood common snappping turtle yang diisolasi menggunakan QIAamp® DNA Mini Kit. Pada penelitian ini, primer yang digunakan adalah (CYTB_F) 5’- GCGCCTCACTCTTCTTCATC-3’ untuk forward dan (CYTB_R) 5’- GCTGAGTTTAGGCCTGTTGG-3’ untuk reverse. Hasil dari PCR akan disekuensing menggunakan metode Sanger. Sekuen gen dianalisa menggunakan program Bioedit dan NCBI BLAST serta MEGA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa jarak genetik antara sampel C1 Cekrik, C2 Mini, dan C3 Yeni terhadap database genebank Chelydra serpentina (accession number EF122793.1) sebesar 0%. Sedangkan jarak genetik ketiga sampel apabila dibandingkan dengan Macrochelys temminckii sebesar 13,9%, 20,8% dengan Dermatemys mawii, dan 23,5% dengan Kinosternon arizonense. Kesimpulan dari penelitian ini adalah sampel common snapping turtle (Chelydra serpentina) berkerabat dekat dalam satu spesies yang sama dan memiliki susunan sekuen DNA yang berbeda dengan Macrochelys temminckii, Dermatemys mawii, dan Kinosternon arizonense