Identifikasi Warna Rambut Kelinci New Zealand (Oryctolagus Cuniculus) Berdasarkan Sequence Gen Mc1r (Melanocortin 1 Receptor) Dengan Metode Pcr
| Main Author: | Novariani, Isma Aulia |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
, 2019
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/176803/1/ISMA%20AULIA%20NOVARIANI%20%282%29.pdf http://repository.ub.ac.id/176803/ |
Daftar Isi:
- Kelinci New Zealand (Oryctolagus cuniculus) merupakan salah satu kelinci populer di Indonesia yang sering diperlombakan karena warna rambutnya yang memiliki daya tarik tersendiri. Kelinci New Zealand terbagi menjadi empat berdasarkan warna rambutnya yaitu Kelinci New Zealand Black, Red, Blue, dan White (Albino). Perbedaan warna rambut yang dimilikinya dipengaruhi oleh ekspresi gen Melanocortin 1 receptor (MC1R). MC1R merupakan gen pengkode produksi melanin pada kulit dan rambut. Penelitian ini bertujuan mengetahui adanya perbedaan sekuen gen MC1R pada Kelinci New Zealand dengan metode PCR. Sampel yang digunakan berupa DNA yang diisolasi dari masing-masing satu sampel darah Kelinci New Zealand Black, Red, dan White (Albino). Amplifikasi DNA dilakukan dengan metode PCR menggunakan sepasang primer forward (MC1R_F) 5’- GTG GAC CGC TAC ATC TCC AT -3’ dan reverse (MC1R_R) 5’- TCT CAC CAG GAG CAC AAC AG -3’ yang didesain melalui Primer3Plus menggunakan database NCBI FN658677.1. Analisa sekuen gen dilakukan sekuensing dengan metode Sanger. Hasil sekuen dianalisa menggunakan software Bioedit dan BLAST NCBI. Hasil penelitian menunjukkan sampel Kelinci New Zealand Black terdapat mutasi 2 transisi dan 9 mutasi transversi yang mempengaruhi susunan asam amino, sehingga disebut mutasi miss sense. Pada Kelinci New Zealand Red dan White (Albino) terdapat 1 mutasi transisi pada sekuen ke-369 yang tidak merubah susunan asam amino sehingga disebut silence mutation. Kesimpulan dari penelitian ini adalah terdapat perbedaan urutan basa nukleotida yang mempengaruhi susunan asam amino gen MC1R pada Kelinci New Zealand Black. Sedangkan pada Kelinci New Zealand Red dan White (Albino) perbedaan urutan basa nukleotida tidak mempengaruhi susunan asam amino gen MC1R.