Implementasi Metode Fuzzy k-Nearest Neighbor (Fk-NN) untuk klasifikasi jenis kanker berdasarkan susunan protein
| Main Author: | Utami, Tahtri Nadia |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
, 2018
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/161785/1/Tahtri%20Nadia%20Utami.pdf http://repository.ub.ac.id/161785/ |
Daftar Isi:
- Penyakit kanker merupakan penyakit paling mematikan setelah penyakit jantung. Penyebab umum terjadinya kanker adalah mutasi gen yang terjadi pada protein 53 yang berfungsi untuk mengendalikan replikasi DNA sebagai pengatur fungsi sel sehingga menyebabkan kesalahan susunan protein. Susunan protein dijadikan dasar dalam mengklasifikasi jenis kanker yang kemudian dapat membantu menentukan penanganan atau terapi yang tepat. Klasifikasi jenis kanker dilakukan dengan menggunakan metode Fuzzy k-Nearest Neighbor (Fk- NN). Data yang digunakan merupakan 752 data sekuens protein dengan panjang sekuens yaitu 393. Kelas klasifikasi meliputi kelas bukan kanker, kelas kanker payudara, kelas kanker usus dan kelas kanker paru-paru. Metode Fk-NN menghitung derajat keanggotaan masing-masing kelas pada k jarak terkecil dari hasil perhitungan jarak metode k-Nearest Neighbor (k-NN). Rata-rata tingkat akurasi tertinggi yaitu 52.56% dari hasil pengujian menggunakan k-foldvalidation. Nilai k optimal metode Fk-NN adalah k = 5 dengan rata-rata tingkat akurasi sebesar 54.99%. Variasi jumlah data latih yang besar yaitu 90% dari jumlah dataset menghasilkan tingkat akurasi tertinggi sebesar 55.33%.