Cover Image

Variasi Genetik Ikan Kakap merah (Lutjanus erythropterus) Sebagai Potensi Induk

Main Author: Widyawati, Yuni
Format: Thesis NonPeerReviewed
Terbitan: , 2017
Subjects:
597.7 Perciformes
Online Access: http://repository.ub.ac.id/157883/
ctrlnum 157883
fullrecord <?xml version="1.0"?> <dc schemaLocation="http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc/ http://www.openarchives.org/OAI/2.0/oai_dc.xsd"><relation>http://repository.ub.ac.id/157883/</relation><title>Variasi Genetik Ikan Kakap merah (Lutjanus erythropterus) Sebagai Potensi Induk</title><creator>Widyawati, Yuni</creator><subject>597.7 Perciformes</subject><description> Guna menunjang pelaksanaan perbaikan mutu genetik ikan kakap merah, maka informasi karakteristik genetik induk dan calon induk ikan kakap merah sangat diperlukan untuk mengetahui karakter dan tingkat variasi genetiknya, sehingga dapat mengurangi tingkat inbreeding pada turunan berikutnya. Peranan variasi genetik dalam budidaya yaitu sebagai indikator dalam menentukan stok unggul untuk seleksi dan hibridasi yang menguntungkan dalam sistem budidaya. Metode pengukuran variasi genetik yang digunakan yaitu DNA barcoding dengan marka mitokondria COI. DNA barcoding merupakan suatu metode dalam taksonomi molecular dengan menggunakan urutan DNA pendek untuk mengidentifikasi suatu spesies. Tujuan dari penelitian ini yaitu; (1) Mengetahui dan menganalisis variasi DNA ikan kakap merah yang diambil dari 2 lokasi yang berbeda, (2) Mengkonfirmasi dan membuat gambaran hubungan kekerabatan dengan hasil identifikasi genetika molecular pada sampel ikan kakap merah. Manfaat dari penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi dasar tentang variasi genetik dan hubungan kekerabatan pada ikan kakap merah (Lutjanus erythropterus) yang diambil dari 2 lokasi yang dapat digunakan sebagai potensi induk budidaya ikan kakap merah yang kedepannya bisa menjadi informasi bagi program kawin silang. Data penelitian dianalisis pada daerah sekuens DNA menggunakan software MEGA 5.2 (The Molecular Evalitionary Genetic Analysis). Pada software ini dilakukan proses pengeditan dan pensejajaran (alignment) DNA untuk mendapatkan sekuens gabungan terbaik dan mempermudah identifikasi dengan sekuen DNA yang ada pada genbank (http://ncbi.nlm.nih.gov) dengan menggunakan BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). Analisis keragaman genetik dari setiap sekuen dihitung untuk melihat persentase dari setiap haplotipe, keragaman haplotipe (hd) dan keragaman nukleotida (&#x3C0;) menggunakan software DnaSP 5.10. Analisis jarak genetik dan filogenetik dilakukan dengan melibatkan seluruh sampel ikan kakap merah menggunakan metode neighbor joining. Ikan untuk penelitian dikoleksi dari 2 fishing base yaitu PPN Brondong dan PPN Prigi. Hasil penelitian dari 10 ikan sampel terkonfirmasi sebagai spesies Lutjanus erythropterus dan dari pengukuran meristik dari semua ikan sampel pada sirip dorsal terdapat sebelas (XI) duri keras dan 13-15 jari-jari lunak, pada sirip anal terdapat tiga (III) duri keras dan 8-10 jari-jari lunak. Variasi DNA ikan kakap menunjukkan bahwa panjang sekuen yaitu 655-690 bp, nilai keragaman haplotipe (hd) yaitu 0.700, nilai keragaman nukleotida (&#x3C0;) adalah untuk lokasi Brondong 0,00209 dan lokasi Prigi 0,00507. Nilai Fst yang diperoleh dari hasil peneltian adalah 0,05 dan nilai ini termasuk dalam kategori kecil. &#xD; </description><date>2017-01-20</date><type>Thesis:Thesis</type><type>PeerReview:NonPeerReviewed</type><identifier> Widyawati, Yuni (2017) Variasi Genetik Ikan Kakap merah (Lutjanus erythropterus) Sebagai Potensi Induk. Magister thesis, Universitas Brawijaya. </identifier><relation>TES/597.72/WID/v/2017/041702277</relation><recordID>157883</recordID></dc>
format Thesis:Thesis
Thesis
PeerReview:NonPeerReviewed
PeerReview
author Widyawati, Yuni
title Variasi Genetik Ikan Kakap merah (Lutjanus erythropterus) Sebagai Potensi Induk
publishDate 2017
topic 597.7 Perciformes
url http://repository.ub.ac.id/157883/
contents Guna menunjang pelaksanaan perbaikan mutu genetik ikan kakap merah, maka informasi karakteristik genetik induk dan calon induk ikan kakap merah sangat diperlukan untuk mengetahui karakter dan tingkat variasi genetiknya, sehingga dapat mengurangi tingkat inbreeding pada turunan berikutnya. Peranan variasi genetik dalam budidaya yaitu sebagai indikator dalam menentukan stok unggul untuk seleksi dan hibridasi yang menguntungkan dalam sistem budidaya. Metode pengukuran variasi genetik yang digunakan yaitu DNA barcoding dengan marka mitokondria COI. DNA barcoding merupakan suatu metode dalam taksonomi molecular dengan menggunakan urutan DNA pendek untuk mengidentifikasi suatu spesies. Tujuan dari penelitian ini yaitu; (1) Mengetahui dan menganalisis variasi DNA ikan kakap merah yang diambil dari 2 lokasi yang berbeda, (2) Mengkonfirmasi dan membuat gambaran hubungan kekerabatan dengan hasil identifikasi genetika molecular pada sampel ikan kakap merah. Manfaat dari penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi dasar tentang variasi genetik dan hubungan kekerabatan pada ikan kakap merah (Lutjanus erythropterus) yang diambil dari 2 lokasi yang dapat digunakan sebagai potensi induk budidaya ikan kakap merah yang kedepannya bisa menjadi informasi bagi program kawin silang. Data penelitian dianalisis pada daerah sekuens DNA menggunakan software MEGA 5.2 (The Molecular Evalitionary Genetic Analysis). Pada software ini dilakukan proses pengeditan dan pensejajaran (alignment) DNA untuk mendapatkan sekuens gabungan terbaik dan mempermudah identifikasi dengan sekuen DNA yang ada pada genbank (http://ncbi.nlm.nih.gov) dengan menggunakan BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). Analisis keragaman genetik dari setiap sekuen dihitung untuk melihat persentase dari setiap haplotipe, keragaman haplotipe (hd) dan keragaman nukleotida (π) menggunakan software DnaSP 5.10. Analisis jarak genetik dan filogenetik dilakukan dengan melibatkan seluruh sampel ikan kakap merah menggunakan metode neighbor joining. Ikan untuk penelitian dikoleksi dari 2 fishing base yaitu PPN Brondong dan PPN Prigi. Hasil penelitian dari 10 ikan sampel terkonfirmasi sebagai spesies Lutjanus erythropterus dan dari pengukuran meristik dari semua ikan sampel pada sirip dorsal terdapat sebelas (XI) duri keras dan 13-15 jari-jari lunak, pada sirip anal terdapat tiga (III) duri keras dan 8-10 jari-jari lunak. Variasi DNA ikan kakap menunjukkan bahwa panjang sekuen yaitu 655-690 bp, nilai keragaman haplotipe (hd) yaitu 0.700, nilai keragaman nukleotida (π) adalah untuk lokasi Brondong 0,00209 dan lokasi Prigi 0,00507. Nilai Fst yang diperoleh dari hasil peneltian adalah 0,05 dan nilai ini termasuk dalam kategori kecil.
id IOS4666.157883
institution Universitas Brawijaya
affiliation mill.onesearch.id
fkp2tn.onesearch.id
institution_id 30
institution_type library:university
library
library Perpustakaan Universitas Brawijaya
library_id 480
collection Repository Universitas Brawijaya
repository_id 4666
subject_area Indonesian Language Collection/Kumpulan Karya Umum dalam Bahasa Indonesia*
city MALANG
province JAWA TIMUR
shared_to_ipusnas_str 1
repoId IOS4666
first_indexed 2021-10-28T05:05:48Z
last_indexed 2021-10-28T07:43:26Z
recordtype dc
_version_ 1751454385761681408
score 17.538404

Lihat Juga