Peta Distribusi dan Diversitas Genetis Anaphalis spp. Berdasarkan Intron trnL di Sepanjang Jalur Pendakian Menuju Puncak Gunung Semeru Taman Nasional Bromo Tengger Semeru
| Main Author: | Kurniawan, LukmanHaris |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed |
| Terbitan: |
, 2013
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/157804/ |
Daftar Isi:
- Anaphalis spp. adalah tumbuhan khas dataran tinggi yang merupakan perintis pada daerah dataran tinggi yang status terkini keberadaannya di keseluruhan wilayah Taman Nasional Bromo Tengger Semeru (TNBTS) masih belum sepenuhnya diketahui. Penelitian terakhir menunjukkan bahwa di salah satu wilayah TNBTS yaitu di kaldera Tengger tidak ditemukan Anaphalis javanica (Hakim dan Nakagoshi, 2006). Selain itu juga terdapat ancaman-ancaman terhadap populasi Anaphalis spp. yang apabila dibiarkan maka lambat laun akan menyebabkan kepunahan. Oleh karena itu perlu dilakukan penelitian mengenai keberadaan, data spasial dan diversitas genetis Anaphalis spp. pada salah satu wilayah TNBTS yaitu di sepanjang jalur pendakian Gunung Semeru sebagai upaya untuk mendapatkan informasi yang lebih luas dalam rangka untuk menentukan strategi dan managemen konservasi Anaphalis spp. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan jenis-jenis, peta distribusi, dan diversitas genetis Anaphalis spp. berdasarkan intron trn L di sepanjang jalur pendakian menuju puncak Gunung Semeru. Pemetaan distribusi tumbuhan Anaphalis spp. di sepanjang jalur pendakian menuju puncak gunung Semeru TNBTS dilakukan dengan menggunakan metode survey , pengamatan dan pencatatan data koordinat dengan menggunakan GPS pada tempat ditemukannya Anaphalis spp. di sepanjang jalur pendakian. Data koordinat yang didapatkan kemudian diplotkan pada peta dengan menggunakan aplikasi Quantum (Q ) 1.8.0 (Lisboa) dan di- overlay dengan layer lain. Data koordinat yang telah diplotkan diolah lebih lanjut dengan menggunakan fitur geoprocessing tools yang ada di dalam Q . Fitur buffer untuk menentukan zonasi habitat Anaphalis spp. dan fitur intersect untuk mengetahui zona habitat yang ditempati secara bersama antara masing-masing spesies Anaphalis . Diversitas genetis didapatkan berdasarkankan identifikasi variasi sekuens trn L. DNA diisolasi menggunakan metode CTAB dari daun Anaphalis spp. yang diambil dari titik pengambilan sampel di Ranuregulo, Waturejeng, Ayek-ayek, Ranukumbolo, Jambangan, Kalimati, dan Arcopodo. Selanjutnya dilakukan elektroforesis gel agarosa dan amplifikasi dengan menggunakan primer universal yang mengamplifasi intron trn L. Amplikon selanjutnya di sequencing dan dilanjutkan dengan alignment dan analisis filogenetik dengan menggunakan program MEGA5. Terdapat tiga spesies Anaphalis yang ditemukan di sepanjang jalur pendakian menuju puncak Gunung Semeru yaitu Anaphalis viscida, Anaphalis longifolia, dan Anaphalis javanica . Peta distribusi hasil dari analisis Quantum menunjukkan bahwa Anaphalis viscida dan Anaphalis javanica terdapat pada daerah-daerah tanpa kanopi pohon lain yang lebat. Anaphalis longifolia lebih mampu bertahan tumbuh pada dearah dengan kanopi lebat maupun juga pada daerah tanpa kanopi. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa untai intron trn L belum mampu untuk digunakan dalam menganalisis diversitas genetis pada genus Anaphalis yang ada di sepanjang jalur pendakian menuju puncak Gunung Semeru. Hal ini dikarenaakan terlalu konservnya untai tersebut dan kurang bervariasinya susunan basa nukleotidanya serta hanya terdapat satu variasi basa nukleotida.