Filogenetik dan Zoogeografi Microhyla (Tschudi, 1838) dari Paparan Sunda Berdasarkan Gen Mitokondrial 16S rRNA

Main Author: Firdaus, AnggunSausan
Format: Thesis NonPeerReviewed
Terbitan: , 2016
Subjects:
Online Access: http://repository.ub.ac.id/154801/
Daftar Isi:
  • Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengestimasi hubungan kekerabatan dan zoogeografi genus Microhyla berdasarkan gen mitokondrial 16S rRNA dari Paparan Sunda. Tahapan metode penelitian adalah pengumpulan sampel Microhyla di Jawa dan Sumatra; ekstraksi DNA dengan menggunakan kit QIAGEN; sekuensing DNA; rekonstruksi pohon filogenetik dengan program PAUP* dan MrBayes 3.0b4, menggunakan analisis Maximum Likelihood, Maximum Parsimony, dan Bayesian Inference; dan analisis data. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Microhyla dari Paparan Sunda terbagi menjadi beberapa kelompok monofiletik, yaitu kelompok M. achatina (M. achatina, Microhyla sp M. borneensis, M. malang, dan M. orientalis), kelompok M. heymonsi (M. heymonsi dan M. ornata), kelompok M. palmipes (M. palmipes dan M. butleri), dan kelompok M. berdmorei. Clade tersebut memiliki topologi yang valid dan didukung oleh nilai bootstrap yang tinggi (MLBS=97%; MPBS=100%; BPP=100%). Terdapat dua individu yang diperkirakan sebagai spesies baru berdasarkan nilai p-distance yang tinggi (4–5.8%), yaitu Microhyla sp.(a) yang berada dalam satu clade dengan M. achatina dan Microhyla sp.(b) yang berada dalam satu clade dengan M.palmipes. Selain itu, terdapat beberapa catatan distribusi terbaru dari beberapa spesies dari genus Microhyla, yaitu M. orientalis di Jawa dan Sumatra; M. ornata di Sumatra; dan M. butleri di Sumatra.