Analisa Kekerabatan Sapi Jaliteng (Jawa Bali Banteng) Berdasarkan Sekuen Gen Cyt-b (Cytochrome b) Dengan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR)

Main Author: Dewanti, Amalia Citra
Format: Thesis NonPeerReviewed
Terbitan: , 2017
Subjects:
Online Access: http://repository.ub.ac.id/1495/
Daftar Isi:
  • Sapi Jaliteng merupakan hasil persilangan antara Banteng Jawa dan Sapi Bali. Kekerabatan genetik dapat digunakan sebagai titik awal untuk meningkatkan kualitas dan kuantitas genetik. Analisis DNA melalui gen Cyt-b (Cytochrome b) mitokondria dapat digunakan untuk mengetahui keragaman genetik. Penelitian ini bertujuan untuk melihat susunan nukelotida Sapi Jaliteng (SJ) serta melihat kekerabatan Sapi Jaliteng dengan Banteng Jawa dan Sapi Bali (SB). Sampel yang digunakan berasal dari Sapi Bali dan Sapi Jaliteng. Amplifikasi gen Cyt-b menggunakan sepasang primer Cytb_F 5‘GCAATTGCCATAGTCCACCT3’ dan Cytb_R 5‘GGATTTGCCGGGGTATAGTT3’ melalui PCR. Produk PCR dilakukan sekuen dengan metode Dideoksi Sanger. Hasil penelitian menunjukkan target gen Cyt-b yang disekuen adalah 212 bp dan hasil penyejajaran didapatkan 168 bp. Jarak genetik berdasarkan sekuen nukleotida ditentukan dengan metode Maximum Composite Likelihood adalah dengan jarak terendah 0,0% dan jarak tertinggi 0,6%. Kesimpulan dari penelitian ini adalah gen Cyt-b dapat digunakan untuk melihat hubungan kekerabatan Sapi Jaliteng (F1 dan F2) terhadap Sapi Bali dan Banteng Jawa.