Analisis Perbedaan Gen Warna Rambut Lutung Jawa (Trachypithecus Auratus) Berdasarkan Sekuen Gen Melanocortin-1 Receptor (Mc1r) Dengan Metode Polymerase Chain Reaction (Pcr)
| Main Author: | Abdillah, Muhammad |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed |
| Terbitan: |
, 1900
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/127003/ |
Daftar Isi:
- Lutung Jawa (Trachypithecus auratus) merupakan primata endemik Pulau Jawa dan ditemukan individu dewasa yang memiliki warna rambut hitam dan oranye. Melanocortin- 1 Receptor (MC1R) merupakan gen penentu warna rambut dan kulit pada mamalia. Gen MC1R meregulasi melanosit untuk membentuk pigmen melanin yang kemudian pigmen tersebut menghasilkan eumelanin dan feomelanin. Individu yang memiliki eumelanin memiliki rambut berwarna hitam dibandingkan dengan individu yang memiliki feomelanin lebih memiliki rambut oranye hingga kemerahan. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan perbedaan warna rambut Lutung Jawa berdasarkan sekuen gen MC1R dengan mengisolasi DNA pada folikel rambut lalu dilakukan uji kuantitas dan kualitas DNA, kemudian diamplifikasi menggunakan metode PCR dengan primer MC1R_F 5‘-TCT ATGCACTGCGCTACCAC-3’ dan MC1R_R 5‘-CGTACAGCACAGCCATGAGT-3’, dan dilanjutkan dengan sekuensing terhadap produk PCR serta analisis dilakukan dengan menggunakan software BioEdit dan NCBI BLAST. Hasil penelitian menunjukkan sampel O1 dan H2 memiliki perbedaan basa nukleotida database genebank MC1R pada NCBI. Perubahan Sampel O1 terdapat pada c.596G>A. Telah terjadi perubahan susunan kodon pembentuk asam amino p.166A>T pada daerah transmembrane region gen MC1R. Terjadinya perubahan asam amino p.166A>T (non-polar menjadi polar) diprediksi dapat menghambat sintesis eumelanin sehingga individu Lutung Jawa rambut oranye tetap mensintesis feomelanin. Pada sampel H2, c.560C>G terjadi perubahan susunan kodon asam amino p.187A>G (non-polar menjadi non-polar) pada daerah extracellular loops gen MC1R. Kesimpulan dari penelitian ini adalah terdapat perbedaan sekuen DNA dan asam amino antara Lutung Jawa rambut hitam dan oranye.