GENETIC MUTATION PROFILE OF gyrA AND parC GENE IN CIPROFLOXACINRESISTANCE Pseudomonas aeruginosa
| Main Authors: | Hasmono Didik, Kuntaman, Febriana Rosda |
|---|---|
| Format: | Journal Book |
| Bahasa: | ind |
| Terbitan: |
Folia Medica Indonesiana
, 2014
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://opac.unila.ac.id/ucs/index.php?p=show_detail&id=42092 |
Daftar Isi:
- ABSTRAKPseudomonas aeruginosa adalah bakteri gram negatif yang masih menjadi penyebab utama kemungkinan infeksi nosokomial,menyebabkan sekitar 9-10% infeksi di rumah sakit. Infeksi nosokomial biasanya mengancam kehidupan dan sulit untuk diobati.Alasan utama menjadi pathogen adalah resistensi intrinsik yang tinggi terhadap antibiotik. Resistensi terhadap kuinolon meningkatdengan frekuensi yang dilaporkan 12-20%. Alasan utama menonjol sebagai patogen resistensi intrinsik yang tinggi terhadapantibiotik. Resistensi kuinolon meningkat dengan frekuensi dilaporkan 12-20%. Kebanyakan dilaporkan ada mutasi missense dalamtarget kuinolon (subunit gyrA dari girase DNA) pada kodon 83 (T83I), meskipun mutasi lain kadang-kadang juga terjadi. Tingginyatingkat resistensi dapat melibatkan mutasi tambahan di gyrB (girase DNA B subunit) atau parc (topoisomerase IV). Tujuanpenelitian ini adalah untuk menentukan mutasi genetik pada region gen gyrA dan parC di isolat Pseudomonas aeruginosayangresisten terhadap ciprofloxacin. Pengujian sensitivitas bakteri menggunakan metode dilusi (BD Phoenix) dan metode Kirby-Bauer,ekstraksi DNA menggunakan Extract N-AmpTM PCR Kit darah, amplifikasi QRDR gyrA dan parC menggunakan primer berupa 1stBasa OligonucleotideTM dengan thermal cycler BioRadicycler, gel elektroforesis agarosa; pelabelan DNA menggunakan QIAquickPCR Kolom (QIAGEN, Valecia, CA); sekuensing DNA menggunakan Genetic Analyzer ABI Prisma 310, hasil sekuensing diproses --menggunakan Genetic Program version 9.0 dan hasilnya dibandingkan dengan kontrol. Hasil sekuensing memprediksi perubahanasam amino dalam QRDR pada girase DNA (gyrA) dan topoisomerase IV (parC), semua isolat memiliki mutasi berlipat di gyrA danparC. gen gyrA; Glu-53 Ser, Thr-83 Ile, Gly-105 Ala, Glu-106 Arg, Ala-136 Gly, parC gene; Asp-35 Gly, Asp-62Asn, Ser-65 Ala, Ser-87 Leu, Ser87 Trp, dan tambahan silent mutation di semua isolat.(FMI 2014;50:1-5)