Studi In Silico Senyawa Turunan Flavonoid Terhadap Penghambatan Enzim Tirosinase
| Main Author: | Suharna. S, Suharna. S |
|---|---|
| Format: | Report NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | ind |
| Terbitan: |
, 2012
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repositori.uin-alauddin.ac.id/3178/1/Suharna.pdf http://repositori.uin-alauddin.ac.id/3178/ |
Daftar Isi:
- Studi in silico senyawa turunan flavonoid dengan enzim tirosinase di lakukan dengan bantuan komputer menggunakan aplikasi docking moleculer (program Autodock Vina dan MGL Tools 1.5.4), dimana 25 senyawa flavonoid yang di peroleh dari penelitian sebelumnya di gambar struktur 2D menggunakan Hyperchame 8.0, kemudian di optimasi geometri dengan metode semiempirik PM3 yang akan di dockingkan dengan enzim tirosinase dengan kode pdb “1WX4” untuk mengetahui model interaksinya dengan menggunakan parameter fungsi scoring energi bebas ikatan (∆G), yang menunjukkan semakin kecil nilai ∆G dalam kkal/mol maka semakin besar kecenderungan suatu ligan-reseptor untuk berinteraksi secara spontan, dan ikatan hidrogen dengan asam-asam amino di pada binding site (sisi pengikatan) reseptor seperti (Metionin201, Serin206, Glutamine acid182, Asparagine191, Asparagin188, Alanine202, Threoinine203, Arginine55) dan asam amino Histidin194 yang merupakan residu penting yang berikatan langung dengan Cu B. Hasil ∆G yang di peroleh di korelasikan dengan Log IC50 hasil eksperimen menghasilkan nilai korelasi sebesar 0,805, dan persamaan yang di peroleh Log IC50=3. 305∆Gbind +22.859 digunakan untuk mendesain/memodifikasi senyawa baru yang memiliki aktivitas penghambatan tirosinase yang lebih baik dari senyawa-senyawa sebelumnya, dan di peroleh modifikasi (-Br) pada atom C nomor 7 cincin A dan (-OH) pada atom C nomor 3’, dan 4’ cincin B dengan energi ikatan – 7,4 kkal/mol dan IC50 prediksi sebesar 0.02 μM.