Konstruksi primer untuk mendeteksi mutasi gen rpoB Mycobacterium tuberculosis
Main Author: | Arif Sardi |
---|---|
Format: | Journal |
Terbitan: |
Fakultas Sains dan Teknologi UIN Ar-Raniry Banda Aceh
|
Subjects: |
Daftar Isi:
- Mengetahui secara cepat resistansi obat pada Mycobacterium tuberculosis adalah hal yang sangat penting untuk efisiensi pengobatan dan pengontrolan penyakit tersebut. lebih dari 95% resistan riF terjadi karena adanya mutasi titik pada daerah sepanjang 81-bp dari gen rpoB M. tuberculosis. umumnya mutasi terjadi pada kodon 531,526 dan 516. salah satu cara yang dapat mendeteksi mutasi tersebut adalah dengan menggunakan metode ARMS-PCR. untuk bisa menerapkan teknik ARMS-PCR dalam mendeteksi mutasi yang terjadi dibutuhkan suatu primer yang khusus dan spesifik. proses konstruksi primer dilakukan dengan menggunakan softwere komputer "primer designer" dan spesifisitasnya dikonfirmasi dengan "bioedit". ketepatan dan kemampuan ketiga primer tersebut dalam mendeteksi mutasi gen rpoB M. tuberculosis diuji menggunakan metode ARMS-PCR dan selanjutnya dianalisis menggunakan teknik elektroforesis pada agarosa 1,5%. hasil elektroforesis menunjukan adanya dua pita yang terbentuk dari hasil amplifikasi menggunakan template H37RV (wild type). kedua pita tersebut diperkirakan berada pada posisi 238 bp dan 484 bp, sedangkan pada hasil amplifikasi menggunakan template strain mutan menghasilkan satu pita sepanjang 484 bp. data tersebut diketahui bahwa reaksi ARMS-PCR yang dilakukan bisa digunakan untuk mendeteksi mutasi gen rpoB M.tuberculosis.