Analisis Keragaman Genetik Tanaman Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Pusat Penelitian Kelapa Sawit (PPKS) Berdasarkan Primer SSR (Simple Sequence Repeats)
| Main Author: | Aulia, Riski |
|---|---|
| Other Authors: | Siregar, (Luthfi A.M., Bayu, Eva Sartini |
| Format: | Bachelors application/pdf |
| Bahasa: | ind |
| Terbitan: |
Universitas Sumatera Utara
, 2018
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
https://repositori.usu.ac.id/handle/123456789/9337 |
Daftar Isi:
- 120301121
- RISKI AULIA. 2017. Analisis Keragaman Genetik Tanaman Kelapa Sawit (E. Guineensis Jacq.) Pusat Penelitian Kelapa Sawit (PPKS) Berdasarkan Primer SSR (Simple Sequence Repeats). Dibimbing oleh EVA SARTINI BAYU, LUTHFI A. M. SIREGAR, dan RETNO DIAH SETIOWATI. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh keragaman genetik dalam dan antar populasi E.guineensis menggunakan marka SSR. Penelitian ini telah dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler Pusat Penelitian Kelapa Sawit , Marihat, Pematangsiantar, Sumatera Utara pada bulaan Maret 2016 s/d Januari 2017. Sebanyak 100 sampel dari tanaman kelapa sawit yang digunakan dalam penelitian ini, yaitu 20 sampel dari populasi E. guineensis TR01S, 20 sampel dari E. guineensis BJ022S, 20 sampel dari populasi E. guineensis BJ42S, 20 sampel populasi E. guineensis BO52S, dan 20 sampel dari populasi E. guineensis MA19S. Perhitungan dan analisis deskriptif pada penelitian ini menggunakan software GeneMarker® version 2.40, software DARwin version 6.0.13 dan Microsoft Excell 2007. Hasil penelitian menunjukkan bahwa total pola pita yang dideteksi sebanyak 104 pola pita dengan kisaran 8-9 pola pita per primer, dan ukuran pola pita berkisar 101 bp–328 bp. Primer mEgCIR2569 merupakan primer yang paling banyak mengamplifikasi DNA dan rata-rata dari persentase polimorfisme pada primer yang digunakan sebesar 71%. Analisis dendogram mebagi 100 sampel ke dalam 3 kelompok besar dengan jarak genetik yang berkisar antara 0,03-1,00 Berdasarkan hasil analisis kekerabatan genetik dengan menggunakan metode Matrix Dissimilarity Simple Matching nilai analisis faktorial (PCoA) dinyatakan dengan aksis I dan aksis II pada 12 primer SSR sebesar 20,3%.
- RISKI AULIA. 2017. Genetic diversity analysis of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) Indonesian Oil Palm Research Institute (PPKS) Based on Primer SSR (Simple Sequence Repeats), supervised by EVA SARTINI BAYU, LUTHFI A. M. SIREGAR, and RETNO DIAH SETIOWATI. The aimed of this research was to obtain information of genetic diversity within and among populations of E. guineensis using SSR markers. This research was conduted in Biology Moleculer Laboratory, Indonesian Oil Palm Research Institute, Marihat, Pematangsiantar, North Sumatera from March 2016 to January 2017. A total of 100 palm oil samples used in this research, including 20 samples from the populations of E. guineensis TR01S, including 20 samples from the populations of E. guineensis BJ022S, including 20 samples from the populations of E. guineensis BJ42S, including 20 samples from the populations of E. guineensis BO52S, and including 20 samples from the populations of E. guineensis MA19S. Calculation and Desciptive analysis in this research using software GeneMarker® version 2.40, software DARwin version 6.0.13 and Microsoft Excell 2007. Research shows that the number of banding patterns detected 104 The banding patterns WITH range 8-9 per primary banding pattern, and the size of the banding patterns ranging from 101 bp -328 bp. mEgCIR2569 primary is the most widely primer to amplify DNA and the average of the percentage of polymorphism in the primer being used by 71%. Analysis dendogram 100 samples All 3 hearts big group of Jatropha genetic WITH BETWEEN Yang ranged from 0.03 to 1.00 Based on the findings of the analysis of genetic relationships WITH Matrix Method using differences Simple Matching Value factorial analysis (PCoA) declared WITH axis I and axis II ON 12 SSR primer of 20.3%.