ANALISIS ASAM AMINO GEN FUSION (F) DAN PREDIKSI EPITOP SEL-B VIRUS NEWCASTLE DISEASE ISOLAT SURABAYA SEBAGAI KANDIDAT VAKSIN
| Main Author: | INDAH LAILI RAHMAWATI, 061514453001 |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | ind |
| Terbitan: |
, 2017
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.unair.ac.id/67111/1/TVI.%2005-17%20Rah%20a%20abstrak.pdf http://repository.unair.ac.id/67111/2/TVI.%2005-17%20Rah%20a%20fulltext.pdf http://repository.unair.ac.id/67111/ http://lib.unair.ac.id |
Daftar Isi:
- Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan patotipe berdasarkan susunan cleavage site asam amino protein F dan prediksi epitop sel-B protein F dari virus ND isolat Surabaya. Sampel penelitian berupa usapan kloaka 28 ekor ayam kampung yang diambil dari lima pasar unggas dalam wilayah Surabaya, 9 isolat positif milik Laboratorium Virologi dan Imunologi Departemen Mikrobiologi Universitas Airlangga serta Isolat positif LaSota (ATCC). Sampel diisolasi pada TAB dan diidentifikasi melalui uji HA yang dikonfirmasi dengan uji HI. Kemudian dilakukan PCR menggunakan primer forward dan reverse dengan target 687 bp. Prediksi epitop menggunakan program online software IEDB. Analisis cleavage site asam amino menunjukan 2 isolat dari pasar unggas Surabaya dan 3 isolat milik Laboratorium Virologi dan Imunologi termasuk dalam patotipe lentogenik. Hasil prediksi epitop sel B dari masing-masing isolat menunjukkan terdapat 11-12 kandidat epitop sel B pada protein F sehingga disimpulkan isolat Surabaya dapat berpeluang sebagai kandidat imunogen yang dapat digunakan sebagai kandidat vaksin.