AMPLIFIKASI GEN PENYANDI CARBOHYDRATE BINDING MODULE (CBM) GbtXyl43B DARI Geobacillus thermoleovorans IT-08
| Main Author: | IKA QURROTUL AFIFAH, 081015063 |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | ind |
| Terbitan: |
, 2014
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.unair.ac.id/28271/1/gdlhub-gdl-s1-2014-afifahikaq-37552-4.-abstr-k.pdf http://repository.unair.ac.id/28271/2/MPK.%2075-14%20Afi%20a.pdf http://repository.unair.ac.id/28271/3/MPK.%2075-14%20Afi%20a.pdf http://repository.unair.ac.id/28271/ http://lib.unair.ac.id |
Daftar Isi:
- Carbohydrate Binding Module (CBM) merupakan sisi non katalitik yang berperan untuk meningkatkan efisiensi katalitik enzim melalui pengikatan terhadap substrat polisakarida tak larut. Penelitian ini bertujuan untuk mengamplifikasi gen penyandi Carbohydrate Binding Module (CBM) GbtXyl43B beserta linkernya dari Geobacillus thermoleovorans IT-08 dan mengetahui urutan basa nukleotidanya. Amplifikasi dengan teknik PCR dilakukan menggunakan sepasang primer forward dan reverse yang diberi nama FCBM1 dan RCBM1. Primer didesain berdasarkan urutan Carbohydrate Binding Module (CBM) GbtXyl43B beserta linkernya pada urutan asam amino 1-156 gen penyandi exo-xilanase putative yang telah terdeposit dalam GenBank No. DQ387047. Hasil analisis menggunakan elektroforesis membuktikan bahwa amplikon memiliki ukuran gen sekitar 0,4 kb. Ukuran tersebut dikonfirmasi dengan hasil sekuensing menggunakan metode Sanger. Dari hasil pensejajaran dengan Basic Local Alignment Search Tool (BLAST), sekuen gen hasil amplifikasi terbukti sama dengan sekuen Carbohydrate Binding Module (CBM) GbtXyl43B target.