IDENTIFIKASI MOLEKULER JAMUR ENDOFIT PADA DAUN BUAS-BUAS (Premna pubescens Blume) BERDASARKAN rDNA ITS (INTERNAL TRANSCRIBED SPACER) SEBAGAI ANTIBAKTERI TERHADAP BAKTERI Salmonella thypi DAN Pseudomonas aeruginosa
Daftar Isi:
- Identifikasi jamur dengan menentukan taksonominya biasanya didasarkan perbandingan morfologi yang paling menonjol. Identifikasi morfologi tersebut belum memberikan kepastian spesies maupun hubungan kekerabatan dengan spesies. salah satu cara identifikasi yang lebih tepat berdasarkan sekuens DNA ribosomal (rDNA) pada daerah ITS (Internal Transcribed Spacer). Identifikasi secara molekuler berdasarkan urutan DNA ribosomal pada daerah ITS (Internal Transcribe Spacer) merupakan salah satu usaha untuk mengidentifikasi dan membuka informasi genetik suatu jamur endofit. Isolat jamur endofit daun buas-buas (Premna pubescens, Blume) diuji untuk melihat potensi antibakteri terhadap bakteri Salmonella typhi dan Pseudomonas aeruginosa untuk mengetahui potensi antibakterinya kemudian isolat jamur endofit yang memiliki potensi sebagai antibakteri akan diisolasi DNA nya selanjutnya akan dilakukan amplifikasi DNA dengan daerah ITS menggunakan pasangan primer ITS1 dan ITS4. Pada hasil pengamatan makroskopis, mikroskopis, dan identifikasi molekuler dengan mengisolasi DNA dan dianalisis dengan BLAST, dan pohon filogenetik jamur endofit yang ditemukan tergolong dalam genus Aspergillus. Isolasi Jamur endofit dari daun buas-buas memperoleh delapan isolat jamur endofit. Kedelapan isolat jamur endofit tersebut memiliki potensial sebagai antibakteri dengan diameter daya hambat yang berbeda-beda terhadap bakteri uji. pengamatan molekuler dengan menggunakan penanda ITS (Internal Transcribed Spacer) dengan primer ITS1 dan ITS4 teridentifikasi bahwa IJT2 memiliki kekerabatan dengan Genus Aspergillus namun lebih dekat dengan Aspergillus neoellipticus ATCC 16903 dengan persentase kemiripan 100%.