IDENTIFIKASI MARKA- MARKA MOLEKULER POLIMORFIK YANG DIDUGA BERKAITAN DENGAN KOMPONEN HASIL TINGGI PADA BEBERAPA KULTIVAR PADI (Oryza sativa L.)
| Main Author: | Lukman, Pradita Nella |
|---|---|
| Format: | bachelorthesis doc-type Bachelors |
| Bahasa: | ind |
| Terbitan: |
, 2014
|
| Online Access: |
http://repository.unpad.ac.id/frontdoor/index/index/docId/14866 |
Daftar Isi:
- ABSTRAK Pradita Nella Lukman. 2014. Identifikasi Marka-Marka Molekuler Polimorfik yang Diduga Berkaitan dengan Komponen Hasil Tinggi pada Beberapa Kultivar Padi. Dibimbing oleh Farida Damayanti dan Nono Carsono. Identifikasi marka polimorfik yang diduga berasosiasi dengan karakter daya hasil tinggi sangat penting dilakukan untuk aplikasi seleksi berbasis marka dalam rangka perakitan padi berdaya hasil tinggi. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi 30 genotip padi yang diduga berdaya hasil tinggi dengan menggunakan 6 marka SSR dan 4 gene-specific primer. Percobaan dilakukan pada bulan Juli sampai Desember 2013 di Laboratorium Analisis dan Bioteknologi Tanaman Fakultas Pertanian Universitas Padjadjaran. Amplifikasi produk PCR dipisahkan dengan menggunakan gel agarose 3% dan atau polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) 8%. Tingkat keinformatifan marka ditentukan dengan cara penghitungan Polymorphic Information Content (PIC). Hasil amplifikasi PCR menunjukkan bahwa dari 10 primer yang digunakan, hanya 6 primer yang terseleksi karena primer tersebut dapat menghasilkan pita polimorfik, yaitu RM259, RM282, FLO, OsDOS, OsBLE3, MOC1. Nilai polimorfisme enam marka berkisar antara 0,1-0,7 dimana marka RM259, RM282, dan OSBLE3 memiliki nilai PIC ≥ 0.5 dan dikategorikan sebagai marka informatif. Diperoleh tiga genotip terseleksi berdasarkan marka SSR dan gene specific yaitu #1 (Fatmawati), #3 (Inpari13), dan #30 (IPB 160-F-3-3-1) yang dapat direkomendasikan sebagai tetua persilangan guna perakitan padi yang berdaya hasil tinggi. Kata Kunci: hasil tinggi, PIC, marka polimorfis, dan padi.