Isolasi dan Karakterisasi Gen Pengkode Endoglukanase Asal Bakteri Laut Bacillus subtilis dan Bacillus thuringiensis Dari Rumput Laut
Daftar Isi:
- Endoglukanase merupakan enzim yang memiliki peranan penting dalam kegiatan pemecahan selulosa, diperlukan secara luas pada berbagai industri berbasis selulosa. Salah satu sumber penghasil enzim endoglukanase adalah bakteri yang berasal dari laut. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret sampai Mei 2013 di Laboratorium Bioteknologi Perikanan dan Kelautan Universitas Padjadjaran. Isolat bakteri yang digunakan yaitu isolat bakteri B.subtilis dan B.thuringiensis. Penelitian ini dilakukan untuk mengisolasi dan mengkarakterisasi gen pengkode enzim endoglukanase dari isolat bakteri B.subtilis dan B.thuringiensis. Metode penelitian menggunakan metode eksploratif dan dianalisis secara deskriptif. Tahapan penelitian meliputi peremajaan biakan dan kultur padat, uji aktivitas selulolitik, desain primer gen endoglukanase, penapisan gen pengkode endoglukanase menggunakan metode PCR, dan analisis bioinformatik. Hasil penelitian menunjukkan nilai indeks selulolitik pada isolat bakteri B.subtilis sebesar 1,67 mm dan isolat bakteri B.thuringiensis sebesar 2,71 mm. Pada tahap penapisan menggunakan metode PCR berhasil mengisolasi gen pengkode endoglukanase dari genom bakteri B.subtilis dan B.thuringiensis dengan ukuran masing-masing 1151 bp (383 aa) dan 1258 bp (418 aa). Hasil karakterisasi In Silico menunjukkkan bahwa kedua sekuen protein gen pengkode endoglukanase tersebut secara fungsional memiliki aktifitas yang ditunjukkan dari ditemukannya domain fungsional dan sisi aktif. Analisis perbandingan diantara kedua sekuen juga menunjukkan tingkat kemiripan yang sangat tinggi, hal ini dapat mengindikasikan kekerabatan gen yang dekat diantara kedua sekuen protein tersebut