Karakterisasi Kandidat Bakteri Probiotik dari Ikan Sidat (Anguilla Bicolor) sebagai Anti Aeromonas Berbasis Analisis Molekuler
Daftar Isi:
- Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Februari sampai Mei 2013 di Laboratorium Bioteknologi Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Padjadjaran. Sampel berasal dari komoditas budidaya sidat di Desa Cisondari, Ciwidey, Jawa Barat. Penelitian ini dilakukan untuk mencari bakteri kandidat probiotik dari usus ikan sidat (Anguilla bicolor) yang berpotensi dalam mengurangi serangan bakteri patogen Aeromonas hydrophila. Metode penelitian menggunakan analisis deskriptif, identifikasi molekuler dengan primer universal gen 16S rRNA yaitu 27F dan 1492R. Tahapan penelitian meliputi kultivasi bakteri, uji produksi asam, uji tantang dan identifikasi molekuler gen 16S rRNA. Isolat bakteri dipilih berdasarkan ukuran zona hambat tertinggi dan terendah, lalu dilanjutkan dengan identifikasi molekuler yang meliputi isolasi DNA, amplifikasi gen 16S rRNA dan analisis bioinformatik. Hasil penelitian didapatkan 8 Isolat murni bakteri, dimana 7 diantaranya dapat menghasilkan senyawa asam. Isolat FJ 1 memiliki ukuran zona hambat tertinggi sebesar 17,7 mm dan isolat FJ 7 memiliki ukuran zona hambat terendah yaitu 6,4 mm. Hasil identifikasi molekuler gen 16S rRNA menunjukkan spesies bakteri FJ 1 adalah Bacillus amyloliquefaciens dan isolat FJ 7 adalah Bacillus cereus. Bacillus amyloliquefaciens sebagai kandidat bakteri probiotik memiliki aktivitas antimikroba tertinggi dalam menghambat pertumbuhan bakteri Aeromonas hydrophila.