Analisis Molecular Docking Senyawa Garcinia Mangostana L Sebagai Kandidat Anti SARS-CoV-2
| Main Authors: | Rena, Suci Ramda, Nurhidayah, Nurhidayah, Rustan, Rustan |
|---|---|
| Format: | Article info application/pdf eJournal |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
Universitas Andalas
, 2022
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://jfu.fmipa.unand.ac.id/index.php/jfu/article/view/730 http://jfu.fmipa.unand.ac.id/index.php/jfu/article/view/730/626 http://jfu.fmipa.unand.ac.id/index.php/jfu/article/downloadSuppFile/730/51 |
Daftar Isi:
- Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi dari senyawa-senyawa alami Garcinia mangostana L. atau kulit manggis sebagai kandidat anti-SARS-CoV-2 dengan menghambat main protease (MPro) COVID-19. Dalam penelitian ini digunakan metode molecular docking dengan program Autodock Vina dan di-visualisasi-kan dengan program Discovery Studio. Kemampuan inhibitor dinilai berdasarkan energi bebas ikatan (ΔG), Konstanta inhibisi (Ki), kompleks ligan-reseptor dan ikatan hidrogen. Validasi dilakukan dengan re-docking ligan alami X77 terhadap protein target (6W63) dengan hasil RMSD 1.082 Å. Simulasi docking dari 3 ligan uji diperoleh 1 senyawa dengan afinitas terbaik yang menghasilkan ΔG = -7.8 kcal/mol dan Ki = 1,91 μM. Berdasarkan hasil penelitian, diantara ligan uji senyawa beta-mangostin paling berpotensi sebagai kandidat anti-SARS-CoV-2 dengan afinitas terbaik.