Skrining turunan alkaloid sebagai kandidat inhibitor protease dari varicella zoster virus menggunakan pendekatan molecular docking / Fadly Ghozali
| Main Author: | Ghozali, Fadly |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed |
| Terbitan: |
, 2019
|
| Online Access: |
http://repository.um.ac.id/94365/ |
Daftar Isi:
- viiRINGKASANGhozaliFadly.2019.SkriningTurunanAlkaloidsebagaiKandidatInhibitorProteasedariVaricellaZosterVirusmenggunakanPendekatanMolecularDocking.SkripsiJurusanKimiaFakultasMatematikadanIlmuPengetahuanAlamUniversitasNegeriMalang.Pembimbing(I)Dr.H.YahminS.Pd.M.Si.(II)Dr.SuhartiS.Pd.M.Si.KataKuncialkaloidVZVproteasevaricellazostervirusmoleculardockingVaricellaZosterVirus(VZV)adalahsalahsatuvirusyangmenyebabkanpenyakitherpeszoster.Acyclovirmerupakansalahsatusenyawayangsecaraluastelahdigunakansebagaiobatuntukpenyakitherpeszoster.NamunresistensiterhadapobatantiVZVinimulaiterbentukdanjugaobatinimemilikibeberapaefeksampingsepertigagalginjaldanneurotoksiksehinggadiperlukanpencarianobatbaruyanglebihefektifdanaman.VZVproteasemerupakansalahsatuproteaseyangberperanpentingdalamsiklushidupvirusvaricellazoster.HaltersebutmenjadikanVZVproteaseberpotensiuntukdijadikansebagaitargetinhibisikarenaperanannyayangsangatpentingdalamprosesperakitankapsiddanpengemasanDNAvirus.InhibitoryangdigunakanuntukmenginhibisiVZVproteaseyaitusenyawaturunanalkaloid.Senyawaturunanalkaloiddipilihsebagaiinhibitorkarenatelahterbuktisecarainvitrosebagaiantivirusuntukvirusinfluenzaherpessimplexvirus(HSV)dandenguevirus(DENV).PenelitianinibertujuanuntukmemperolehsenyawaturunanalkaloidyangberpotensisebagaiinhibitorVZVproteasedenganmetodependekatanmoleculardockingdanmengkajiinteraksiapasajayangterjadiantaraVZVproteasedengansenyawaturunanalkaloidhasilskrining.Penelitianinitermasukpenelitiandeskriptifkualitatifdenganmenggunakanstudiliteraturyangrelevan.PenelitianinidilakukandengancaramembandingkannilaibindingaffinitydanjugamengkajiinteraksiyangterjadiantarasenyawaturunanalkaloiddenganVZVprotease.PenelitianinidilakukanmenggunakanpendekatanmoleculardockingdenganbantuansoftwarePyRx0.9.5.Metodeyangdigunakanadaduamacamyaitumetodeblinddockingdanmetodespecificdocking.Metodeblinddockingbertujuanuntukmengetahuisifatinhibisisecaranonkompetitifataupununkompetitifdariliganterhadapreseptortargetsedangkanmetodespecificdockinguntukmengetahuisifatinhibisisecarakompetitif.HasildariprosesmoleculardockingkemudiandivisualisasikanmenggunakanbantuanbeberapasoftwarediantaranyasoftwareEduPyMOLLIGPLOTdanDiscoveryStudio.KetigasoftwaretersebutdigunakanuntukmengkajiinteraksiapasajayangterjadiantarasenyawaturunanalkaloiddenganVZVprotease.PadapenelitianinijugadilakukananalisisaturanLipinskiyangbertujuanuntukmengetahuiprofilsenyawaalkaloidyangbisadigunakanuntukobatsecaraoral.HasilpenelitianmenunjukkanbahwadenganmetodeblinddockingdiperolehempatsenyawaturunanalkaloidyangberpotensisebagaiinhibitoruntukVZVprotease.KeempatsenyawaturunanalkaloidtersebutyaitualantrypinonecircumdainElapatinAdanspiroquinazolineyangmemilikinilaibindingaffinityviiiberturut-turut-88-88-9.3dan-89kkal/mol.DarimetodespecificdockingdiperolehempatsenyawaturunanalkaloidyangberpotensiuntukdijadikansebagaiinhibitorVZVprotease.KeempatsenyawaturunanalkaloidtersebutyaitualantrypinonecircumdatinElapatinAdanlapatinBdengannilaibindingaffinityberturut-turut-75-74-66dan-65kkal/mol.HasilvisualisasimolekulmenggunakansoftwareEduPyMOLLIGPLOTdanDiscoveryStudiomenunjukkanterbentuknyaikatanhidrogendaninteraksihidrofobikyangdapatmenstabilkanposisipengikatanligandenganreseptor.HasildarianalisisaturanLipinskimenunjukkanbahwasenyawaalkaloidyangberpotensisebagaiinhibitorVZVproteasetersebutmemilikiprofilyangsesuaidenganlimaaturanLipinskisehinggabisadijadikankandidatobatherpeszostersecaraoral.BerdasarkanhaltersebutdiperolehligancircumdatinEyangmerupakanliganyangpalingberpotensisebagaiinhibitorVZVprotease.Hasilyangdiperolehdalampenelitianiniakanbermanfaatuntukperancangandanpengembanganobatuntukpenyakitherpeszosterdimasayangakandatang.Namunujipadalabbasahperludilakukanuntukmemvalidasisenyawainisebelummenetapkannyasebagaicalonobatyangpotensial.