Analisis hasil persilangan jarak pagar (Jatropha curcas Linn.) berbasis Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) dan pengembangannya sebagai sumber belajar genetika tanaman / Iin Hindun
| Main Author: | Hindun, Iin |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed |
| Terbitan: |
, 2016
|
| Online Access: |
http://repository.um.ac.id/64652/ |
Daftar Isi:
- ABSTRAKHindunIin.2016.AnalisisHasilPersilanganJarakPagar(JatrophacurcasLinn.)BerbasisRandomAmplifiedPolymorphicDNA(RAPD)danPengembangannyaSebagaiSumberBelajarGenetikaTanaman.DisertasiProgramStudiPendidikanBiologiProgramPascasarjanaUniversitasNegeriMalang.Pembimbing(I)Prof.Dr.agr.MohamadAminMSi(II)Prof.Drs.SutimanBambangSumitroS.U.DSc(III)Dr.Ir.MaftuchahMP.KatakunciJatrophacurcasLinn.RAPDSumberBelajarPenelitianinidilatarbelakangiolehproblematikaperkembanganilmugenetikayangcepatdipelajaridilembagapendidikanformaldanproblematikapenyediaanbahantanamjarakpagarsebagaisumberenergialternatifbahanbakarnabati(BBN).Problematikayangdihadapipadapembelajarangenetikadisekolahadalahkonsep-konsepnyamasihsulitdipahamikarenarumitabstrakdansulituntukdihubungkandengankehidupansehari-harisiswasertaditemukanmiskonsepsigenetikapadasiswagurudanbahanajar.Perkembangangenetikayangcepatmenjaditantangandantuntutanbagipendidikuntukmeningkatkankemampuanprofessional(keilmuan)selarasdengantuntutanhakbelajaranakuntukmemperolehpendidikansesuaijamannya.problematikadalampenyediaanbahantanamadalahbelumtersedianyabahantanamdanvarietasyangberkualitas.Kuncisuksesuntukmendapatkanbahantanamdanvarietasadalahtersedianyainformasikeragamangenetiksebanyak-banyaknyadanpersilangandapatmemperluaskeragaman.Kajianmolekulermenggunakanpenandamolekulerdapatmendukungdanmelengkapikajiankeragamanmorfologiyangbelumberhasildalammemprediksikeragamanakibatkuatnyapengaruhlingkungan.RAPD(RandomAmplifiedPolymorphicDNA)merupakansalahsatupenandamolekulersangatmendukungupayaanalisiskeragamangenetikterutamajikalatarbelakanggenomnyabelumdiketahui.Penelitianinibertujuan(1)MendiskripsikankeragamangenetikhasilpersilanganjarakpagarberbasisRAPD(2)MenjelaskanpewarisanmaterigenetikhasilpersilanganjarakpagarberbasisRAPD(3)MenjelaskankedekatanhubungansecaragenetikhasilpersilanganjarakpagarberbasisRAPD(4)Menghasilkanbukunontekssebagaibukusuplemenpelajaransekaligusmenjadibukubacaanbagipenggunayangberkepentingandenganhasilpenelitian.Penelitiandeskriptifdenganobservasilaboratorikdilakukandengantahapanmenyiapkansampeldaunmudajarakpagardari10individuketurunanpertama(F1)hasilpersilangandan6genotipetetuanya.SampeldiisolasiDNAnyakemudiandilanjutkandenganPCR.Persilanganyangdipelajariadaempatkombinasipersilanganmeliputigenotipe(1)SP-8xSP-16(2)SP-8xSP-38(3)SP-33xHS-49(4)SM-35xSP-38.IsolasiDNAdilakukanmenggunakanmetodeCTAB.HasilPCRdiseparasidenganelektroforesis.PCRmenggunakan5primerRAPDyaituOPA-18OPA-19OPA-20OPE-15OPF-5.HasilanalisismolekulerpitaDNAdibacadanditransformasikedalambentukkuantitatif.Pengukuranjumlahaleljenisalelalelpolimorfikdanpewarisanmaterigenetikpenghitungandananalisismenggunakanpersentase.DalammendiskripsikedekatanhubungansecaragenetikpadapopulasihasilpersilanganfragmenDNAdarimasing-masinggenotipediolahmenjadidatabinerdianalisisclusterpengelompokandanpembuatandendogramnyadianalisismenggunakanmetodeUnweightedPairGroupMethod(UPGMA)melaluiprogramMVSP(MultiVariatStatisticalPackage).Hasilpenelitiandapatdisimpulkan(1)Keragamangenetikhasilpersilanganjarakpagarpadajumlahaleljenisaleldanalelpolimorfikditemukanbervariasi.Variasinyasebagaiberikut(a)Jumlahalelditemukandalamjumlahbervariasipadamasing-masingpersilangandanmasing-masingpenggunaanprimer.Dibandingkandengantetuanyaditemukanpolaperbedaanjumlahalelpadatetuajantandanbetina.PadatetuabetinajarakpagarmemilikijumlahalelDNAlebihbanyakdaritetuajantan.(b)AlelpolimorfikyangterdapatpadaketurunanhasilpersilanganditemukandalamproporsiyangbervariasidimanajumlahalelDNApolimorfikproporsinyalebihbanyakdarialelDNAmonomorfik.Jikadibandingkandengantetuanyajumlahalelpolimorfikpadaketurunanjumlahnyaberbalikandenganjumlahyangdimilikiolehtetuayaitualelpolimorfikpadatetuajumlahnyalebihsedikitdaripadaketurunan.DitemukanbahwapenggunaanprimerdanpersilanganyangmampumengamplifikasiDNAdenganjumlahaleljenisaleldanalelpolimorfikpalingtinggiadalahpadaprimerOPF-5danpersilangan3.(2)Pemetaanterhadapjumlahkemiripanalelpadaketurunanterhadaptetuanya(a)PewarisanalelDNAditemukandalamtingkatkemiripanyangbervariasiberdasarjumlahalel.Variasiyangditemukanmenunjukkankemiripandalamjumlahmulaidari0(nol)hingga10alel.(b)Ditemukanvariasibaruyangtidakditemukanpadatetuanyadalamproporsibervariasidimasing-masingpersilanganberkisardari64%hingga88%.(c)HasilanalisisterhadappewarisanalelDNAditemukan6variasipolapewarisandandibedakankedalampewarisantipeparentaldantiperekombinasi.Kemiripantipeparentalproporsinya55%sedangkankemiripantiperekombinasiproporsinya945%.(3)Terdapatvariasikedekatanhubunganataukemiripanketurunandengantetuanya.Kedekatanhubunganantartetuabervariasidimasing-masingpersilangandengannilaikoefisienkemiripanberkisardari084hingga094.Keturunandimasing-masingpersilanganmenunjukkankedekatanyanglebihbervariasidenganrangenilaikoefisienkemiripandari04550941diP10781diP207521diP3dan0733095diP4.Padapersilangan1(P1)variasikemiripanmakinmenjauhkedekatanhubungandengantetuanya.PadaP2P3danP4ditemukanvariasijugakemiripannyanamunkemiripantersebutadayangmakinmenjauhdaritetuatetapiadayangmakindekatdengantetuamaupunmakindekatkemiripandenganindividulainnya.(4)Hasilvalidasiterhadapbukudiperolehpencapaiannilaipadaaspekkelayakanmaterimencapainilai100%penyajianmaterimencapainilai79%penggunaanillustrasimencapainilai83%danpenggunaanbahasamencapai96%.Dengandemikiannilairata-ratayangdiperolehadalah88%yangberartibahwabukumemilikikualifikasibaik.