Analisis keragaman genetik tanaman jarak pagar (Jatropha curcas L.) aksesi unggul persilangan berbasis RAPD sebagai sumber belajar mata kuliah teknik analisis biomolekuler / Baiq Muli Harisanti
| Main Author: | Harisanti, Baiq Muli |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed |
| Terbitan: |
, 2011
|
| Online Access: |
http://repository.um.ac.id/60329/ |
Daftar Isi:
- Tesis.ProgramStudiPendidikanBiologiProgramPascasarjanaUniversitasNegeriMalang.Pembimbing(I)Prof.Dr.YusufAbdurrajak(II)Dr.agr.MohamadAminS.Pd.M.Si.Katakuncijarakpagar(JatrophacurcasL.)RAPDkeragamangenetikJarakPagar(JatrophacurcasL)merupakantanamanyangberpotensimenghasilkanminyaksehinggadapatmenjadipilihantepatsebagaibahanbakubiodiesel.Namunpermasalahanyangmasihdihadapiadalahbelumbanyaktersediavarietasunggulsertateknikbudidayayangmemadaiolehkarenaituperludilakukaneksplorasidenganharapanakanterjaringalel-alelbaruyangbelumterdapatdalamkoleksiplasmanutfahyangada.Alel-alelbarutersebutdapatmunculsalahsatunyadengancaramelakukanpersilanganantaratanamandariberbagaiaksesikoleksiplasmanutfahyangada.OlehkarenaitudiharapkandaripenelitianinidapatdilakukananalisismolekulerdenganteknikRAPDuntukmengetahuikeragamangenetiktanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)unggulhasilpersilangan.Sampeldalampenelitianiniadalahjarakpagar(JatrophacurcasL.)hasilpersilanganpadanomor-nomorunggulyangmeliputi4nomortanamanhasilpersilanganyangberasaldariKalipareJawaTimur.Kodetanamansampeladalahnomor5denganpersilangantetuaSP8XSP16nomor6dengantetuaSP8XSP38nomor7dengantetuaSP33XHS49dannomor18dengantetuaSM35XSP38.ProsesPCR-RAPDmenggunakan8primeryaituOPF1OPF2OPF3OPF4OPF5OPF6OPF14danOPA12.TujuankegiataniniadalahuntukmendapatkanhasilanalisispolapitasidikjariDNAdarigenomjarakpagardenganmenggunakanteknikRAPD.PolapitaDNAdiperolehmelaluiprosespemisahanprodukPCRdenganelektroforesisgelagarose.Polapitayangdiperolehselanjutnyadigunakanuntukdeteksipolimorfismealel-alelDNA.BerdasarkanhasilpenelitiandenganmenggunakandelapanjenisprimerdidapatkantotalpitaDNAsebanyak81pitadariempataksesitanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)unggulhasilpersilangan.Jenisaleldanfrekuensialelpadatanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)unggulhasilpersilangandarihasilRAPDmenggunakandelapanprimer(OPF-1OPF-2OPF-3OPF-4OPF-5OPF-6OPF-14danOPA-12)menunjukkanbahwadarisemuajenisalelRAPDyangterdeteksipadaempataksesitanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)padapenelitianinifrekuensialeltertinggimencapai057(57%)danterendahadalah006(6%).AnalisiskekerabatanmenggunakanpenandaRAPDyangterwujuddalambentukdendogramdaritanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)unggulhasilpersilanganmenunjukkanbahwaaksesidengantetuaSM35XSP38danSP8XSP38memilikitingkatkemiripangenetiklebihkecilyaitu568%dibandingkandengantingkatkemiripangenetikantaraaksesidengantetuaSP33XHS49danSP8XSP16sebesar763%.Hasilpenelitianiniselanjutnyadapatdisusunsebagaisumberbelajarpadamatakuliahteknikanalisisbiologimolekuleryangdikemasdalambentukmodulperkuliahan.Berdasarkanhasilvalidasiahlidananalisisterhadapbahanajar(modul)diperolehtingkatkelayakanbahanajarsebesar8269%yangberartibahwamodultersebutsangatbaikdantidakperludirevisi.Berdasarkanhasilanalisisdapatdisimpulkanbahwatingkatkekerabatanantarakeempataksesijarakpagarunggulhasilpersilanganmasihdekat.Sebaiknyadilakukanjugapenelitiansejenisdenganmenggunakansampel-sampeljarakpagar(JatrophacurcasL.)daribeberapaaksesiyangberasaldaridaerah-daerahdiIndonesiadapatberupatanaman-tanamanjarakpagarliardenganharapandapatterjaringcalon-calontetuapersilanganyangdapatdimanfaatkandalamseleksitanamanunggul.