Analisis keragaman genetik tanaman jarak pagar (Jatropha curcas. L) aksesi unggul dan tipe liar berbasis RAPD sebagai sumber belajar matakuliah teknik analisis biologi molekuler / Fadilla Salim
| Main Author: | Salim, Fadilla |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed |
| Terbitan: |
, 2010
|
| Online Access: |
http://repository.um.ac.id/60306/ |
Daftar Isi:
- Tesis.ProgramStudiPendidikanBiologiProgramPascasarjanaUniversitasNegeriMalang.PembimbingProf.Dr.A.D.CorebimaM.Pd.danDr.agr.MohamadAminS.Pd.M.Si.KatakuncikeragamangenetikRAPDtanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)Kebutuhanterhadapminyakbumiyangcenderungmeningkatmengakibatkanperlunyapemanfaatansumberenergiterbarukansebagaibagianpentingdalamprogramdiversifikasienergi.Alternatifyangidealuntukmengurangitekananpermintaanbahanbakarminyakdanpenghematanpenggunaancadangandevisaadalahdenganpemanfaatanminyaktanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)sebagaibahanbiodiesel.Tanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)merupakantanamankosmopolitandengankatalainsecaraagronomistanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)dapatberadaptasidenganlahandanagroklimatdiIndonesiabahkanpadakondisikeringdanpadalahanmarginal(kritis).Akantetapipermasalahanyangmasihdihadapiadalahbelumadanyavarietasungguldanteknikbudidayayangmemadai.Mengatasipermasalahantersebutmakadilakukaneksplorasi.EksplorasidilakukandibeberapadaerahyaitudiNTB(SM35)NTT(HS49)SulawesiSelatan(SP8SP16SP33SP34SP38)MalukuUtara(TTEJLLSDL)danRandusariPasuruan(RSP).SelaindilakukannyaeksplorasidibeberapadaerahtersebutdilakukanjugateknikRAPDdenganmenggunakanprimerOPA-2OPA-9OPA-13OPA-15OPA-18OPA-19danOPA-20untukmenganalisiskeragamangenetiktanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)aksesiunggulsebanyak7sampel(HS49SP8SP16SP33SP34SP38danSM35)dantipeliarsebanyak4sampel(TTEJLLSDLdanRSP)sehinggadapatmengetahuiapakahadahubungankekerabatanhasilpemuliaantanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)antaraaksesiungguldengantipeliartersebut.TeknikRAPDmerupakansalahsatuteknikyangdigunakandalambidangbiologimolekuleruntukmengetahuitingkatkeragamangenetikdarimakhlukhidup.Rancangandalampenelitianiniadalahpenelitiandeskriptifeksploratifdengantujuanuntukmenganalisiskeragamangenetiktanamanjarakpagar(JatrohpacurcasL.)aksesiungguldantipeliarberbasisRAPDdenganmengkajiekspresifenotipdanekspresigenotipmelaluiDNAdenganmetodeRAPD.Selaianitujugatujuandaripenelitianiniadalahuntukmengetahuimateritentanganalisiskeragamangenetikpadatanamanjarakpagar(JatrohpacurcasL.)denganmenggunakanteknikRAPDdapatdijadikanpenuntunpraktikumsehinggadapatdigunakansebagaibahanajardalammatakuliahteknikanalisisbiologimolekuler.Darihasilpenelitiandiperolehbahwakarateristikfenotiptanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)aksesiungguldantipeliarpadadasarnyamasihsamadengankarateristikfenotiptanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)secaraumumnya.HasilPCR-RAPDdenganmenggunakantujuhjenisprimermenunjukkanbahwasemuaprimermemperlihatkanjumlahpitayangberbedaantartanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)halinidisebabkankarenaterdapatprimeryangtidakdapatmenghasilkanpitaDNA.Adanyaprimeryangtidakmenghasilkanpitamengindikasikanbahwaprimer-primertersebuttidakmempunyaihomologidenganDNAcetakankarenaterbentuknyafragmenpitaDNAtergantungpadasekuenprimerdangenotipdariDNAcetakan.Lokusyangditempatiolehalel-alelyangterdeteksitersebutbersifatpolimorfikkarenadarisemuajenisalelRAPDyangterdeteksipadatujuhaksesidanempattipeliartanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)frekuensialelnyakurangdari095(95%).Berdasarkanhasilanalisiskekerabatandenganmenggunkandendogrammenunjukanbahwaterdapatbeberapatanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)yangberasaldaridaerahataupropinsiyangberbedajustrutingkatkekerabatannyalebihtinggidibandingkandengantanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)yangberasaldaridaerahataupropinsiyangsama.Halinidisebabkankarenasistemklasifikasiberdasarkanpenandamolekuler-RAPDmenghasilkanpengelompokanyangberbedadenganhasilpengelompokanberdasarkanmorfologikarenahanyaberdasarkanpadaanalisisfaktorgenetiksajatanpaadanyapengaruhlingkunganselainitujugaRAPDmempunyaiketerbatasansalahsatunyaadalahtidakdapatmembedakanindividuhomozigotdanheterozigotkarenabersifatsebagaipenandadominan.Faktorpenyebablainterjadinyavariasigenetikantaralainmutasidanrekombinasi.Implikasipenelitianiniberupapenuntunpraktikummatakuliahteknikanalisisbiologimolekulerdenganjudulanalisiskeragamangenetiktanamanjarakpagar(JatrophacurcasL.)berbasisRAPDdapatdigunakansebagaipenuntunpraktikummatakuliahteknikanalisisbiologimolekulerkarenapenuntunpraktikumtersebutmenarikmemadaidansudahlayakdigunakan.