Analisis potensi genetik padi (Oryza sativa L.) lokal Banyuwangi berdasarkan ekspresi relatif gen Homogentisate Geranylgeranyl Transferase (HGGT) / Dyati Galuh Pratita

Main Author: Pratita, Dyati Galuh
Format: Thesis NonPeerReviewed
Terbitan: , 2019
Online Access: http://repository.um.ac.id/26898/
Daftar Isi:
  • iABSTRAKPratitaDyatiGaluh.2019.AnalisisPotensiGenetikPadi(OryzasativaL.)BanyuwangiberdasarkanEkspresiRelatifGenHomogentisateGeranylgeranylTransferase(HGGT).SkripsiJurusanBiologiFakultasMatematikadanIlmuPengetahuanAlamUniversitasNegeriMalang.Pembimbing(I)Dra.DwiListyoriniM.SiD.Sc(II)Dra.SunarmiM.Pd.KataKunciOryzasativaL.EkspresiGenHGGTKualitasgizibuahpadiyangbaiksangatdiminatikonsumendiseluruhduniasalahsatunyaadalahpadidengantokotrienoltinggi.EkspresirelatifgenHGGTdapatdigunakanuntukmenemukanvarietaspadiyangberpotensimenghasilkantokotrienoltinggi.PenelitianinibertujuanuntukmenemukanvarietaspadiyangmemilikipotensitokotrienoltinggiberdasarkantingkatekspresigenHGGTdiantara8varietaspadi(OryzasativaL.)lokalBanyuwangi.MetodepenelitianiniialahquantitativeRealtimePCRuntukmengetahuiekspresirelatifgenHGGTpadapadilokalBanyuwangi.HasilpenelitianinimenunjukkanekspresirelatifgenHGGTpadavarietasHitamMelik(2916Ct16989542)HitamPekat(2916Ct5376001)BlambanganA3(2916Ct4943469)MerahBali(2916Ct3479590)BlambanganA2(2916Ct2599881)Berlian(2916Ct1290429)JanurKuning(2916Ct1173945)danSunriseofJavaA3(2916Ct0356816).HasilujistatistiknonparametrikWilcoxon/KruskalWallismenunjukkanChiSquarehitung(160570)ChiSquaretabeldengan945005(14067)yangberartiterdapatperbedaansignifikanpadadataantarsampel.EkspresirelatifgenHGGTpadapadilokalBanyuwangidariyangtertinggiketerendahadalahpadavarietasHitamMelikHitamPekatBlambanganA3MerahBaliBlambanganA2BerlianJanurKuningdanSunriseofJavaA3.VarietasHitamMelikmemilikiekspresirelatifgenHGGTtertinggisehinggaberpotensimenghasilkantokotrienollebihbanyakjikadibandingkandenganvarietaslainnya.iiABSTRACTPratitaDyatiGaluh.2019.AnalysisofGeneticPotentialinBanyuwangiLocalRice(OryzasativaL.)basedonRelativeExpressionofHomogentisateGeranylgeranylTransferase(HGGT)Gene.ThesisDepartmentofBiologyFacultyofMathematicsandNaturalSciencesStateUniversityofMalang.Supervisor(I)Dra.DwiListyoriniM.ScD.Sc(II)Dra.SunarmiM.Pd.KeywordsOryzasativaL.GeneExpressionHGGTNutritionalqualityofriceisverypopularamongconsumersintheworldoneofthemisricewithhightocotrienol.RelativeexpressionofHGGTcanbeusedtofindricevarietiesthatpotentiallyproducehightocotrienol.AimedofthisresearchistofindricevarietiesthatpotentiallyproducehightocotrienolbasedonthelevelofHGGTgenerelativeexpressionamong8Banyuwangilocalrice(OryzasativaL.)varieties.RelativeexpressionofHGGTgeneisdeterminedbyquantitativeRealtimePCRandanalizedbyrelative2916Ctmethod.ResultshowedrelativeexpressionoftheHGGTgeneinHitamMelik(2916Ct16989542)HitamPekat(2916Ct5376001)BlambanganA3(2916Ct4943469)MerahBali(2916Ct3479590)BlambanganA2(2916Ct2599881)Berlian(2916Ct1290429)JanurKuning(2916Ct1173945)andSunriseofJavaA3(2916Ct0356816).StatisticaltestshowedChiSquarevalue(160570)ChiSquareTablewith945005(14067)sothereissignificantdifferencebetweensamples.ThehighestrelativeexpressionofHGGTtothelowestareHitamMelikHitamPekatBlambanganA3MerahBaliBlambanganA2BerlianJanurKuningandSunriseofJavaA3.HitamMelikhasthehighestrelativeexpressionofHGGTgenesoithaspotentialtoproducemoretocotrienolthanothervarieties.