Skrining turunan flavonod sebagai inhibitor protease NSP2 dari virus chikungunya menggunakan molecular docking / Khoirul Faqih
| Main Author: | Faqih, Khoirul |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed |
| Terbitan: |
, 2018
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.um.ac.id/24011/ |
Daftar Isi:
- viiRINGKASANFaqihKhoirul.2018.SkriningTurunanFlavonoidsebagaiKandidatInhibitorProteasensP2dariVirusChikungunyamenggunakanMolecularDocking.SkripsiJurusanKimiaFakultasMatematikadanIlmuPengetahuanAlamUniversitasNegeriMalang.Pembimbing(I)Dr.YahminS.Pd.M.Si.(II)Dr.SuhartiS.Pd.M.Si.KataKunciflavonoidproteasensP2viruschikungunyamoleculardockingProteasensP2dariviruschikungunyamerupakansalahsatuproteinnonstruktural.Proteinnonstrukturalmemainkanperananpentingdalamreplikasiviruschikungunya.HaltersebutmenjadikanproteasensP2berpotensisebagaitargetyangharusdiinhibisikarenaperanannyayangsangatpentingdalamreplikasigenomdariviruschikungunya.InhibisiproteasensP2akanmenghambatperkembangbiakanvirusyangberakibatpadapemutusansiklushidupvirus.Salahsatusenyawayangberpotensisebagaiinhibitoradalahsenyawaturunanflavonoid.Senyawaturunanflavonoiddipilihsebagaiinhibitorkarenatelahterbuktisebagaiantivirusuntukvirusinfluenzaherpesdandemamberdarah.PenelitianinibertujuanuntukmendapatkansenyawaturunanflavonoidyangberpotensisebagaiinhibitorproteasensP2dariviruschikungunyadenganmetodemoleculardockingdanmengkajiinteraksiapasajayangterjadiantarasenyawaturunanflavonoidhasilskriningdenganproteasensP2dariviruschikungunya.PenelitianinimerupakanpenelitiandeskriptifkualitatifdengancaramembandingkannilaibindingaffinityhasilmoleculardockingdanvisualisasimolekulantarasenyawaturunanflavonoiddenganproteasensP2dariviruschikungunya.Rancangandalampenelitianinidiawalidengantahapstudiliteraturyangrelevan.MoleculardockingdilakukandengansoftwarePyRx0.8.SenyawakelompokflavonoidyangdiujiterdiridarienamkelompokyaituflavonflavonolisoflavonoidflavanonkalkondanantosianinyangberpotensisebagaiinhibitorproteasensP2dariviruschikungunya.Darienamkelompokflvanoidtersebutdiambilempatsenyawaberdasarkannilaibindingaffinityterbaik.Masing-masingsenyawatersebutyaitusianidinkationdelpinidinmalvidinpeonidinarbutinkalkonnaringeninphloretinphlorizinbaicaleingalanginluteolinrhoifolinkaempferolmyricetinquersetinrutinhesperidinhesperitinnaringeninnaringindaidzingenisteingenistindanglisitein.VisualisasimolekulhasilprosesmoleculardockingdengansoftwareEduPyMOLLIGPLOTdanDicsoveryStudiodigunakanuntukmengkajiinteraksiapasajayangterjadi.HasilpenelitianmenunjukkanbahwasetelahmelaluiprosesmoleculardockingmenggunakansoftwarePyRx0.8senyawaturunanflavonoidyangberpotensisebagaiinhibitordarienamkelompokflavonoidyaituhesperidinrhoifolinmyricetingenistinpeonidinphlorizinyangmempunyainilairootmeanssquaredeviation(RMSD)senilai08491dengannilaibindingaffinityberturut-turut-94-85-81-79-76dan-69kkal/mol.HasilvisualisasimolekulmenggunakansoftwareEduPyMOLLIGPLOTdanDicsoveryStudiosecaraumummenunjukkanterjadinyainteraksihidrofobikdanterbentuknyaikatanviiihidrogen.Berdasarkanhaltersebutdapatdisimpulkanbahwahesperidinyangmerupakangolonganflavanonmemilikipotensiyanglebihdarisenyawagolonganflavonoidyanglaindengannilaibindingaffinitysebesar-94kkal/mol.