Perbandingan Discrete Cosine Transform (DCT) dan Analisis Komponen Utama (AKU) Pada Data Microarray Ekspresi Gen
| Main Author: | MHadiSantoso |
|---|---|
| Format: | Thesis NonPeerReviewed Book |
| Bahasa: | eng |
| Terbitan: |
, 2008
|
| Subjects: | |
| Online Access: |
http://repository.ub.ac.id/151762/1/050801451.pdf http://repository.ub.ac.id/151762/ |
Daftar Isi:
- Microarray adalah bagian baru di bidang bioteknologi yang digunakan untuk mengamati tingkat ekspresi ribuan gen secara simultan. Microarray juga memiliki peranan penting dalam penelitian farmasi dan klinis. Data microarray ekspresi gen terdiri atas banyak dimensi yang saling berhubungan. Reduksi dimensi merupakan pendekatan yang sering dilakukan karena dapat mengekstraksi ciri-ciri penting data dan mengurangi tingkat kesulitan pada analisis lanjut. Dua metode yang digunakan adalah Discrete Cosine Transform (DCT) dan Analisis Komponen Utama (AKU). Dua metode ini diterapkan pada dua data (ekspresi gen jamur dan respon fibroblast terhadap serum). Setelah melakukan DCT dan AKU, hasil transformasi digunakan untuk analisis kelompok dengan mengambil beberapa peubah hasil transformasi. Berdasarkan nilai CTM yang dihitung dari hasil analisis kelompok disimpulkan bahwa DCT dan AKU memiliki kemampuan sama dalam mereduksi dimensi karena nilai CTM hasil pengelompokan 2 peubah hasil transformasi mendekati nilai CTM data asli.